More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2995 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  100 
 
 		 213 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  33.92 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 218 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  29.28 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  32 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  27.22 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  29.9 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1946  cytochrome c553  28.96 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.871766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  30.81 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0029  cytochrome c553  25.27 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  32.51 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 179 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  30.19 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  26.99 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  28.98 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  28.98 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  30.32 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  32.14 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  31.46 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  31.07 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  28.41 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  48.1 
 
 		 125 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  46.84 
 
 		 112 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  28.09 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  28.42 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  32.86 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  30.68 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  29.52 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  28.18 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  29.86 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0546  cytochrome c, class I  27.14 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  31.07 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  29.48 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  30.68 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  28.67 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  26.9 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  27.32 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  26.14 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  29.86 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  47.83 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  27.33 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  27.33 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  28.98 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  45.07 
 
 		 108 aa  72  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  29.33 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  28.19 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  40.4 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  48 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  29.05 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  25.83 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  46.38 
 
 		 104 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  39.42 
 
 		 102 aa  70.9  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  26.4 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  26.4 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  28.19 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  41.77 
 
 		 98 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  31.94 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  27.33 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  25.15 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  42.5 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  43.04 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  40.85 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  28.7 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  41 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  23.91 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  40.19 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  25.12 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  26.44 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  30.65 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  25 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  28.26 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  47.06 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  27.97 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  28.81 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  26.63 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  49.32 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  25.42 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  28.49 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  27.27 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  27.93 
 
 		 382 aa  68.2  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  29.91 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  29.51 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  27.05 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  27.63 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  46.38 
 
 		 124 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  26.62 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  26.62 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  26.62 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  26.63 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  27.32 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  26.71 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  42.31 
 
 		 126 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  27.93 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  27.32 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  29.41 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  29.14 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  26.67 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  24.66 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  26.06 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>