More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_2005 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  100 
 
 		 127 aa  258  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  60.16 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  56.69 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  53.85 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  57.02 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  73.97 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  49.28 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  43.24 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  46.58 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  43.24 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  47.83 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  45.71 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  44.74 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  39.24 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  47.83 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  43.66 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  38.96 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  43.06 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  44 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  37.23 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  38.03 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  40.54 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  38.67 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  42.47 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  45.45 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  31.48 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  36.26 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  41.43 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  40.58 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  36.96 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  39.39 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  37.66 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  30.17 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  30.56 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  30.56 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  38.16 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  32.89 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  37.21 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  37.84 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  44.44 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  46.88 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  40 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  40.48 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  36.9 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  36.9 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  37.8 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  37.33 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1404  cytochrome c, class I  36 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  36.36 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 273 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4249  putative cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  36.84 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.22639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  35.71 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  39.29 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  39.29 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  39.29 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  39.29 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  39.29 
 
 		 265 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  39.29 
 
 		 265 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4954  Cytochrome c553-like protein  31.71 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  32.91 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  38.75 
 
 		 223 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  35.71 
 
 		 281 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  38.81 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  39.39 
 
 		 219 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4365  cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  36.84 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 222 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 206 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 227 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  33.33 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  35.44 
 
 		 206 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  35.21 
 
 		 239 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  36.76 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  33.77 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  39.39 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  36.14 
 
 		 211 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  39.68 
 
 		 210 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 221 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  35.71 
 
 		 261 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  37.18 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  31.94 
 
 		 200 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  39.29 
 
 		 545 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 216 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  32.69 
 
 		 284 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  34.29 
 
 		 257 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  34.29 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  35.44 
 
 		 207 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  35.44 
 
 		 207 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>