More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1422 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  100 
 
 		 222 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  42.2 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  37.04 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  39.06 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  39.13 
 
 		 217 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  38.5 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  36.07 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  39.57 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  40.46 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  34.04 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  34.68 
 
 		 256 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  38.8 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  35.47 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  37.16 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  34.3 
 
 		 226 aa  111  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  32.37 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  34.38 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  37.57 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  39.55 
 
 		 382 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  34.07 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  33.18 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  33.03 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  35.23 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  33.91 
 
 		 240 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  32.6 
 
 		 243 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  35.23 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  32.93 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  32.93 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  32.93 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  32.93 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  32.93 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  34.66 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  32.93 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  32.93 
 
 		 249 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  34.44 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  34.66 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  33.66 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  32.6 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  33.72 
 
 		 208 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0542  putative cytochrome c  33.5 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  33.89 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  33.33 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  33.14 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  33.52 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  35.48 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  29 
 
 		 257 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  31.87 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  34.76 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  33.17 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  33.17 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  33.17 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  30.59 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  31.28 
 
 		 209 aa  98.6  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  31.4 
 
 		 217 aa  98.6  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  30.85 
 
 		 257 aa  98.2  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  31.4 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  32.93 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  33.91 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  31.89 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  30.29 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  32.93 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  32.93 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2279  cytochrome c  31.13 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  31.21 
 
 		 246 aa  95.9  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  32.34 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  32.34 
 
 		 236 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  31.14 
 
 		 236 aa  95.5  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  32.34 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  36.78 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  36.78 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  36.21 
 
 		 219 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  30.56 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  32.34 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  33.71 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  33.14 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  30.29 
 
 		 281 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1399  cytochrome c553-like  34.1 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  30.34 
 
 		 373 aa  92  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  30.22 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  32.75 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  32.8 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  34.46 
 
 		 270 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  31.79 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  30.22 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  34.08 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  33.71 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  33.71 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  33.92 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  32.41 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  32.65 
 
 		 179 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  30.56 
 
 		 200 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  31.55 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  30.11 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  30.43 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>