298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2279 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2279  cytochrome c  100 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1720  cytochrome c  61.14 
 
 		 217 aa  280  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  48.78 
 
 		 284 aa  216  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  48.79 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  51.06 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  50 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  46.36 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  47.57 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  49.04 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1242  putative cytochrome c  53.63 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.291072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  54.19 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  51.1 
 
 		 283 aa  185  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  44.55 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  44.08 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  44.72 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  44.08 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  48.63 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  48.63 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  48.63 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  48.63 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  48.63 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  48.63 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  48.63 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  47.19 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  47.19 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  47.19 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  47.19 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  47.19 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  47.19 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  46.7 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  39.82 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  47.19 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  45.36 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  41.83 
 
 		 281 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1399  cytochrome c553-like  48.09 
 
 		 203 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  46.15 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  46.15 
 
 		 236 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  46.15 
 
 		 236 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  44.32 
 
 		 240 aa  171  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  47.75 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  33 
 
 		 220 aa  99  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  35.87 
 
 		 216 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 216 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  36.57 
 
 		 217 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  30.96 
 
 		 202 aa  95.1  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  34.88 
 
 		 216 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 226 aa  92  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  32.42 
 
 		 200 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  29.38 
 
 		 215 aa  89  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  34.18 
 
 		 203 aa  89  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 205 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  35.23 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  33.14 
 
 		 204 aa  88.2  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  33.95 
 
 		 208 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  29.41 
 
 		 205 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 205 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  31.61 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  36.78 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  32 
 
 		 203 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  32.47 
 
 		 222 aa  85.5  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  32.96 
 
 		 267 aa  85.5  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  28.28 
 
 		 256 aa  85.1  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  31.61 
 
 		 217 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  31.61 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  36.52 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  30 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  34.25 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  34.48 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  30.7 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  30.7 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  34.25 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  27.94 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  34.25 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  30 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  30.62 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  31.03 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  32.02 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  33.53 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  32.75 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  29.67 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  26.25 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  30.66 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  30.66 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  30.19 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  33.14 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  30.21 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  26.8 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  30.99 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  27.93 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0670  cytochrome c553  28.85 
 
 		 205 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.680454  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  30.99 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  30.59 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  30.99 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  30.99 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0542  putative cytochrome c  28.57 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  28.97 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  33.52 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  29.52 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1404  cytochrome c, class I  32.52 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>