More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1283 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  100 
 
 		 261 aa  529  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  88 
 
 		 284 aa  387  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  78.33 
 
 		 257 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  62 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  58.77 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  58.45 
 
 		 243 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  56.67 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  57.75 
 
 		 283 aa  235  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1242  putative cytochrome c  55.24 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.291072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  53.46 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  53.46 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  53.46 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  53.46 
 
 		 249 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  60.23 
 
 		 236 aa  225  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  60.23 
 
 		 249 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  52.75 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  52.75 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  60.23 
 
 		 249 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  60.23 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  59.66 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  52.29 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  59.09 
 
 		 229 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  59.09 
 
 		 229 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  59.09 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1720  cytochrome c  50.72 
 
 		 217 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  48.52 
 
 		 243 aa  214  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2279  cytochrome c  48.79 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  48.1 
 
 		 243 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  59.66 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  50.48 
 
 		 235 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  55.56 
 
 		 238 aa  204  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  50.95 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  50 
 
 		 239 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  49.51 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  46.12 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  49.51 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  49.51 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1399  cytochrome c553-like  52.94 
 
 		 203 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  47.42 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  50.26 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  41.86 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  38.03 
 
 		 216 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  37.56 
 
 		 217 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  35.9 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  38.29 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  34.03 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  32.75 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  35.51 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  36.31 
 
 		 224 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  35.07 
 
 		 202 aa  102  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  37.58 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  31.87 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  31.28 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  37.21 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  37.21 
 
 		 217 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  36.42 
 
 		 217 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  35.23 
 
 		 205 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  32.18 
 
 		 318 aa  99  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  35.29 
 
 		 213 aa  99  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  36.42 
 
 		 217 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 222 aa  99  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  32.42 
 
 		 205 aa  98.6  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  33.52 
 
 		 207 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  33.52 
 
 		 207 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  33.52 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  35.23 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  31.79 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  34.55 
 
 		 262 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  35.23 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  32.63 
 
 		 200 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  32.63 
 
 		 200 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  31.87 
 
 		 207 aa  95.5  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  33.52 
 
 		 207 aa  95.5  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  33.52 
 
 		 207 aa  95.5  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  33.52 
 
 		 207 aa  95.5  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  33.52 
 
 		 207 aa  95.5  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  34.2 
 
 		 205 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  40.83 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  31.03 
 
 		 207 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  32.54 
 
 		 199 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  32.78 
 
 		 203 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  35 
 
 		 204 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  35.12 
 
 		 196 aa  93.2  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  33.02 
 
 		 217 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  31.84 
 
 		 206 aa  92.4  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  31.18 
 
 		 219 aa  92  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  30.59 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  33.14 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  34.3 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  34.3 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  32.95 
 
 		 205 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  34.88 
 
 		 219 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  34.3 
 
 		 200 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  30.6 
 
 		 206 aa  90.1  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  31.67 
 
 		 206 aa  90.1  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  32.35 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  29 
 
 		 200 aa  90.1  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  31.84 
 
 		 207 aa  89.4  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>