More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2865 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  41.58 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  44.78 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  44.51 
 
 		 213 aa  131  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  42.78 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  43.86 
 
 		 267 aa  124  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  38.8 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  42.13 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  42.13 
 
 		 217 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  42.29 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  41.71 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  42.08 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  36.1 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  39.68 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  38.86 
 
 		 284 aa  115  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  41.48 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  40.33 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  40 
 
 		 382 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  38.29 
 
 		 261 aa  111  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  40.91 
 
 		 217 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 217 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  37.71 
 
 		 257 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  38.33 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 217 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  39.01 
 
 		 199 aa  111  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  44.91 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  40.34 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  37.22 
 
 		 271 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  40.34 
 
 		 217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  40.34 
 
 		 217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  40.44 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  40.34 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  40.34 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  40.34 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  40.34 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  40.34 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  40.34 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  40.34 
 
 		 545 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  38.67 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  40.46 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  35.1 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  35.1 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  35.1 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  38.95 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  38.95 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  38.95 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  39.88 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  38.95 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  38.95 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  41.24 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  37.85 
 
 		 224 aa  104  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  36.45 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  40 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  36.49 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  36.76 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  35.47 
 
 		 249 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  35.47 
 
 		 253 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  35.47 
 
 		 253 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  34.27 
 
 		 240 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  35.47 
 
 		 253 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  35.47 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  35.47 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  35.47 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  38.64 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  33.95 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  33.89 
 
 		 318 aa  101  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  37.21 
 
 		 236 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  39.77 
 
 		 219 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  34.48 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  39.18 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  38.5 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  36.05 
 
 		 236 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  38.5 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  36.42 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  39.2 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  36.42 
 
 		 373 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  32.6 
 
 		 283 aa  98.6  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  35.03 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  33.91 
 
 		 243 aa  98.2  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  34.12 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1399  cytochrome c553-like  40.57 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  37.93 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  33.01 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  35.43 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  35.43 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  36.36 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  35.43 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  38.2 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  34.34 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  35.8 
 
 		 217 aa  95.9  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  33.65 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  35.8 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 228 aa  95.5  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  33.33 
 
 		 253 aa  94.7  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  33.84 
 
 		 208 aa  94.7  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  32.76 
 
 		 243 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  39.43 
 
 		 219 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  39.43 
 
 		 219 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0542  putative cytochrome c  36.14 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>