More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0159 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  100 
 
 		 256 aa  517  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  76.47 
 
 		 220 aa  318  5e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  36.62 
 
 		 237 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  40 
 
 		 208 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  39.52 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  40.22 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  40.48 
 
 		 208 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  41.06 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  38.33 
 
 		 217 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  40.1 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  41.34 
 
 		 207 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  39.61 
 
 		 216 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  38.07 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  38.33 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  41.11 
 
 		 208 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  40.78 
 
 		 208 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  40.78 
 
 		 208 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  38.31 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  40.45 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  38.04 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  38.64 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  41.21 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  40.78 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  39.64 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  39.77 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  36.46 
 
 		 203 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  35.32 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  34.33 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  37.7 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  44.58 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  33.16 
 
 		 200 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  37.82 
 
 		 318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  34.27 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  34.64 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  36.42 
 
 		 236 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  34.56 
 
 		 210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  35.84 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  31.98 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  35.26 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  32.99 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  35.26 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  35.26 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  35.26 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  35.26 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  35.26 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  35.26 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  35.26 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  36.76 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  35.26 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  35.26 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  36.76 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  38.12 
 
 		 382 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  35.26 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  35.26 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  37.23 
 
 		 219 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 211 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  35.2 
 
 		 281 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  37.29 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  37.02 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  37.29 
 
 		 219 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  34.64 
 
 		 284 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  34.74 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  35 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  39.52 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  35.43 
 
 		 202 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  35.09 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  34.74 
 
 		 207 aa  106  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  34.74 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  34.74 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  34.74 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  34.74 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  34.74 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1242  putative cytochrome c  34.74 
 
 		 245 aa  105  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.291072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  33.99 
 
 		 191 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  33.7 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  35.29 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  32.68 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  35.33 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  33.98 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  36.75 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  33.5 
 
 		 213 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  37.43 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  33.5 
 
 		 213 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  32.68 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  34.27 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  34.27 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  34.81 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  34.27 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  36.24 
 
 		 373 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  35.9 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  37.29 
 
 		 223 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  37.1 
 
 		 269 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  32.77 
 
 		 195 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  37.06 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  36.57 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  32.28 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  33.64 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>