More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8113 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  100 
 
 		 235 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  62.23 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  61.8 
 
 		 238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  61.8 
 
 		 236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  61.8 
 
 		 236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  60.09 
 
 		 235 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  61.57 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  61.29 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  61.29 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  61.11 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  59.91 
 
 		 254 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  59.91 
 
 		 254 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  59.91 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  53.97 
 
 		 249 aa  248  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  53.97 
 
 		 249 aa  248  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  53.97 
 
 		 253 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  53.97 
 
 		 253 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  53.97 
 
 		 253 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  53.97 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  59.51 
 
 		 234 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  57.08 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  56.16 
 
 		 243 aa  244  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  56.62 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  53.25 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  52.34 
 
 		 257 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  52.11 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  53.56 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1399  cytochrome c553-like  60.5 
 
 		 203 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1242  putative cytochrome c  57.29 
 
 		 245 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.291072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  56.78 
 
 		 228 aa  218  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  55.38 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  56.22 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  51.2 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  49.56 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  54.05 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  51.46 
 
 		 243 aa  208  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  53.17 
 
 		 281 aa  205  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2279  cytochrome c  49.04 
 
 		 243 aa  201  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  48.74 
 
 		 283 aa  201  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1720  cytochrome c  48.68 
 
 		 217 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  38.95 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  36.52 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  38.92 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  32.37 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  37.71 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  33.52 
 
 		 318 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  40.98 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  34.6 
 
 		 210 aa  105  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  35.52 
 
 		 237 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  36.05 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  33.17 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  35.47 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  31.78 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  35.58 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  34.31 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  33.52 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  39.34 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 199 aa  99.4  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  32.8 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  34.1 
 
 		 213 aa  98.2  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  34.12 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  33.53 
 
 		 200 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  31.73 
 
 		 202 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  37.65 
 
 		 262 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  36.42 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  38.8 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  32.76 
 
 		 256 aa  96.3  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  30.37 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  34.09 
 
 		 210 aa  96.3  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  36.42 
 
 		 208 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  37.36 
 
 		 208 aa  95.5  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  33.53 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  32.87 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  33.53 
 
 		 196 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  35.84 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  31.94 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  31.94 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  35.84 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  31.16 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  32.97 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  32.95 
 
 		 205 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  35.47 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  31.48 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  32.41 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  34.86 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  32.41 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  32.41 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  32.41 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  30.3 
 
 		 200 aa  92.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  30.3 
 
 		 200 aa  92.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 221 aa  92.4  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  30.04 
 
 		 227 aa  92.4  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  33.15 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  35.5 
 
 		 208 aa  92  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  32.09 
 
 		 207 aa  91.7  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  34.86 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  30.69 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  30.84 
 
 		 206 aa  91.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>