More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5047 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  98.63 
 
 		 219 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  60.65 
 
 		 218 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  63.18 
 
 		 218 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  52.34 
 
 		 218 aa  221  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  50.92 
 
 		 223 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  50.92 
 
 		 223 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  50.46 
 
 		 223 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  42.52 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  48.22 
 
 		 292 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  41.74 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  48.34 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  38.04 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  37.42 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  40.91 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  35.85 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  40 
 
 		 318 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  40.12 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  38.15 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  37.57 
 
 		 200 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  33.77 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  37.28 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  38.07 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  37.79 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  38.86 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  36.65 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  36.75 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  35.35 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  38.65 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  36.57 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  37.87 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  36.57 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  36.57 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  35.8 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  37 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  37.65 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  35.8 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  37.91 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  35.16 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  36.99 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  35.68 
 
 		 193 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  36.7 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  35.59 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  35.23 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  33.92 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  37.7 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  35.23 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  36.93 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  36.93 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  32.2 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  33.93 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  36.09 
 
 		 200 aa  96.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  39.53 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  34.39 
 
 		 205 aa  96.7  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  36.51 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  35.03 
 
 		 188 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  33.68 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  38.86 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  39.29 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  35.47 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  39.23 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  38.69 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  38.69 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  39.43 
 
 		 207 aa  95.1  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  34.66 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  38.69 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  35.8 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  37.43 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  37.29 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  38.29 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  39.18 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  35.75 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  35.75 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  36 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  34.71 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  36 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 219 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  34.66 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  33.9 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 242 aa  92.8  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  35.47 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 254 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  38.86 
 
 		 281 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 254 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  39.11 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  39.05 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>