More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4074 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  100 
 
 
257 aa  530  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  92.86 
 
 
237 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  75.1 
 
 
240 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  66.02 
 
 
254 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  66.02 
 
 
254 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  66.02 
 
 
236 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  66.02 
 
 
236 aa  279  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  65.53 
 
 
229 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  65.53 
 
 
229 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  65.05 
 
 
236 aa  276  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  56.33 
 
 
253 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  56.33 
 
 
253 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  56.33 
 
 
253 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  56.33 
 
 
249 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  56.33 
 
 
249 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  56.33 
 
 
249 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  64.04 
 
 
234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  53.36 
 
 
243 aa  268  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  52.94 
 
 
243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  53.16 
 
 
239 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  64.04 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  60.19 
 
 
235 aa  251  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  57.64 
 
 
238 aa  251  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  57.64 
 
 
238 aa  248  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  57.64 
 
 
236 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  57.64 
 
 
236 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1399  cytochrome c553-like  60.5 
 
 
203 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  56.31 
 
 
235 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  47.06 
 
 
243 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  54.55 
 
 
240 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  52.26 
 
 
228 aa  209  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1242  putative cytochrome c  51.76 
 
 
245 aa  209  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.291072  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  51.46 
 
 
257 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  50.76 
 
 
284 aa  202  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  49.76 
 
 
261 aa  201  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  50.25 
 
 
283 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  50 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  48.26 
 
 
281 aa  195  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1720  cytochrome c  47.57 
 
 
217 aa  193  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2279  cytochrome c  39.82 
 
 
243 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  36.92 
 
 
226 aa  122  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  35.5 
 
 
215 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  43.2 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  35.48 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  33.16 
 
 
220 aa  112  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  36.78 
 
 
318 aa  111  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  35.88 
 
 
213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  38.04 
 
 
217 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  37.97 
 
 
216 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  33.02 
 
 
207 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  37.71 
 
 
210 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  37.57 
 
 
207 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  35.71 
 
 
206 aa  105  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  37.57 
 
 
207 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  37.02 
 
 
207 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  36.26 
 
 
217 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  33.98 
 
 
256 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  35.36 
 
 
216 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  38.24 
 
 
201 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  29.41 
 
 
237 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  38.24 
 
 
196 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  36.84 
 
 
217 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  37.78 
 
 
216 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  34.44 
 
 
202 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  30.7 
 
 
229 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  36.46 
 
 
207 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  36.46 
 
 
207 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  36.46 
 
 
207 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  36.46 
 
 
207 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  35.36 
 
 
205 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  36.16 
 
 
207 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  35.59 
 
 
206 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  32.02 
 
 
205 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  35.36 
 
 
207 aa  99.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  34.87 
 
 
204 aa  99.8  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  34.81 
 
 
207 aa  99.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  36.1 
 
 
203 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  32.95 
 
 
207 aa  98.6  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  31.43 
 
 
206 aa  98.6  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  35.16 
 
 
205 aa  98.6  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  31.44 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  35.94 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  34.39 
 
 
210 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  31.87 
 
 
206 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  32.75 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  36.36 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  32.75 
 
 
219 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  32.56 
 
 
200 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  42.6 
 
 
228 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  34.25 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  35.29 
 
 
199 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  34.27 
 
 
221 aa  97.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  30.81 
 
 
206 aa  95.9  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  33.93 
 
 
208 aa  95.5  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  28.85 
 
 
209 aa  95.5  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  33.52 
 
 
226 aa  95.5  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  33.82 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  32.51 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  33.82 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  34.86 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>