More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2985 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  100 
 
 		 281 aa  561  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  57.14 
 
 		 284 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  61.46 
 
 		 283 aa  235  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1242  putative cytochrome c  58.57 
 
 		 245 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.291072  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  57.89 
 
 		 240 aa  232  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  57.14 
 
 		 228 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  49.03 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  49.03 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  50.82 
 
 		 236 aa  225  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  55.77 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  55.29 
 
 		 236 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  54.81 
 
 		 229 aa  221  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  54.81 
 
 		 229 aa  221  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  53.08 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  53.73 
 
 		 243 aa  218  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  55.72 
 
 		 234 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  55.72 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  55.72 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  55.72 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  55.72 
 
 		 249 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  55.72 
 
 		 249 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  55.72 
 
 		 249 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  53.73 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  53.55 
 
 		 239 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  48.17 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  51.74 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  51 
 
 		 243 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  55.72 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  48.31 
 
 		 238 aa  202  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  53.17 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  47.76 
 
 		 240 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  47.46 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  47.46 
 
 		 236 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  47.46 
 
 		 236 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  49.5 
 
 		 235 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1399  cytochrome c553-like  50.25 
 
 		 203 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  48.76 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1720  cytochrome c  44.98 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  48.26 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2279  cytochrome c  41.83 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  34.98 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  33.85 
 
 		 271 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  35.63 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  38.76 
 
 		 217 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  37.43 
 
 		 216 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  34.88 
 
 		 217 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  38.29 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  38.82 
 
 		 262 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  35.88 
 
 		 199 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  35.06 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  34.86 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  32.78 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  32.43 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  32.8 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  32.09 
 
 		 205 aa  99  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  30.32 
 
 		 237 aa  98.6  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  35.43 
 
 		 204 aa  98.2  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  31.75 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  35.56 
 
 		 208 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  32.32 
 
 		 238 aa  96.3  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  35.56 
 
 		 208 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  35.56 
 
 		 208 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  35.56 
 
 		 208 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  34.66 
 
 		 373 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  33.89 
 
 		 208 aa  94.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  33.15 
 
 		 203 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  35.63 
 
 		 208 aa  93.6  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  34.32 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  31.58 
 
 		 213 aa  93.2  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 219 aa  92.8  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  31.02 
 
 		 206 aa  93.2  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  38.86 
 
 		 219 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  35 
 
 		 208 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  38.86 
 
 		 219 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  30.86 
 
 		 207 aa  92.4  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  33.33 
 
 		 217 aa  92.4  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  31.46 
 
 		 205 aa  92  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  34.02 
 
 		 208 aa  92  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  32.35 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  28.26 
 
 		 209 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  32.95 
 
 		 202 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  32.37 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  30.73 
 
 		 205 aa  90.5  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  38.29 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  31.89 
 
 		 223 aa  90.1  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  29.79 
 
 		 227 aa  89  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  31.35 
 
 		 206 aa  88.6  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  33.52 
 
 		 188 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  34.55 
 
 		 205 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  31.52 
 
 		 206 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  30.65 
 
 		 206 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  36.9 
 
 		 168 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  29.38 
 
 		 200 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  29.38 
 
 		 200 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  32.35 
 
 		 200 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  31.36 
 
 		 226 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  28.9 
 
 		 200 aa  86.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  31.61 
 
 		 203 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  32.95 
 
 		 219 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>