More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1404 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1404  cytochrome c, class I  100 
 
 
263 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  64.54 
 
 
262 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  64.11 
 
 
262 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  64.11 
 
 
262 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  64.11 
 
 
262 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  61.78 
 
 
266 aa  324  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  57.25 
 
 
270 aa  285  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  51.11 
 
 
269 aa  258  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  50.74 
 
 
269 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  47.99 
 
 
269 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  38.2 
 
 
200 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  39.78 
 
 
213 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  40.34 
 
 
209 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  37.64 
 
 
200 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  37.04 
 
 
205 aa  106  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  36.87 
 
 
238 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  40.48 
 
 
219 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  37.97 
 
 
207 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  39.76 
 
 
262 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  36.46 
 
 
209 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  37.43 
 
 
223 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  38.95 
 
 
318 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  36.67 
 
 
207 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  38.54 
 
 
219 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  35.83 
 
 
205 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  39.77 
 
 
205 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  37.75 
 
 
219 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  36.36 
 
 
205 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  40.62 
 
 
265 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  39.77 
 
 
219 aa  99.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  40.59 
 
 
219 aa  99  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  33.16 
 
 
271 aa  98.6  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  39.77 
 
 
211 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  37.5 
 
 
217 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  34.17 
 
 
216 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  35.4 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  37.5 
 
 
217 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  35.87 
 
 
207 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  35.87 
 
 
207 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  35.87 
 
 
207 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  34.07 
 
 
227 aa  96.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  40 
 
 
265 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  40 
 
 
265 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  40 
 
 
215 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  40 
 
 
206 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  40 
 
 
206 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  40 
 
 
206 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  35.33 
 
 
207 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  40 
 
 
545 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  35.33 
 
 
207 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  35.33 
 
 
207 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  36.61 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  35.33 
 
 
207 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  40.23 
 
 
217 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  37.28 
 
 
207 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  41.07 
 
 
208 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  36.69 
 
 
237 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  36.46 
 
 
217 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  34.64 
 
 
206 aa  94  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  38.95 
 
 
238 aa  93.6  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  40.23 
 
 
217 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  36.52 
 
 
225 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  35 
 
 
206 aa  92.8  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  34.44 
 
 
207 aa  92.8  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  36.26 
 
 
240 aa  92.8  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  36.09 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  35.91 
 
 
200 aa  92.8  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  40.23 
 
 
217 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  40.23 
 
 
217 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  40.23 
 
 
217 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  34.34 
 
 
209 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  39.53 
 
 
217 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  39.53 
 
 
217 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0670  cytochrome c553  38.46 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.680454  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  35.63 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  35.96 
 
 
220 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  31.84 
 
 
206 aa  90.9  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  38.2 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  33.53 
 
 
249 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  33.53 
 
 
253 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  33.53 
 
 
253 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  33.53 
 
 
253 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  35.33 
 
 
199 aa  89  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  33.53 
 
 
249 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  33.53 
 
 
249 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  35.62 
 
 
292 aa  88.6  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  33.53 
 
 
234 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  34.78 
 
 
207 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  35.29 
 
 
217 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  37.79 
 
 
214 aa  88.6  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  37.82 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  33.52 
 
 
206 aa  88.2  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  38.12 
 
 
212 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  34.64 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  39.26 
 
 
223 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  36.05 
 
 
203 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  31.84 
 
 
206 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  36.36 
 
 
205 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  33.66 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  34.73 
 
 
254 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>