More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0670 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0670  cytochrome c553  100 
 
 		 205 aa  425  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.680454  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 207 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  37.62 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  41.42 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  38.51 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  38.82 
 
 		 265 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  38.82 
 
 		 265 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  35.47 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  38.82 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  38.82 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  38.73 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  38.82 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  38.82 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  34.91 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  34.17 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  41.07 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  38.82 
 
 		 545 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  41.07 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  39.64 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  38.24 
 
 		 202 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  37.38 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  34.52 
 
 		 238 aa  101  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  38.67 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  38.32 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  39.88 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  38.32 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  32.98 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  38.29 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  32.98 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  36.63 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  36.05 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  32.16 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  36.05 
 
 		 217 aa  99  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  35.12 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  36.05 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  36.05 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  38.18 
 
 		 205 aa  98.6  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  34.88 
 
 		 219 aa  98.2  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  36.05 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  36.63 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  36.63 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  36.42 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  34.12 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  35.47 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  34.15 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  34.39 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  34.39 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  36.42 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  34.39 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  32.83 
 
 		 229 aa  95.1  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  33.49 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  36.72 
 
 		 318 aa  94  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  34.39 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  32.67 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  34.39 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  34.39 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  34.39 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  32.28 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  36.14 
 
 		 266 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  32.58 
 
 		 220 aa  93.2  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 270 aa  92  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  35.47 
 
 		 260 aa  91.3  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  31.49 
 
 		 246 aa  91.7  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  31.03 
 
 		 206 aa  91.3  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  29.85 
 
 		 200 aa  91.3  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  29.85 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  35.47 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  31 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  34.07 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  30.48 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  32.8 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  30.54 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  37.35 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  31.65 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  33.54 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  34.55 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  35.03 
 
 		 226 aa  89  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  32.79 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  31.93 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  30.16 
 
 		 223 aa  88.6  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  35.15 
 
 		 219 aa  88.2  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  33.15 
 
 		 271 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2984  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  35.06 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  32.32 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  30.16 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0546  cytochrome c, class I  33.86 
 
 		 249 aa  86.7  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  35.5 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  34.71 
 
 		 269 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  34.5 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1404  cytochrome c, class I  39.49 
 
 		 263 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1720  cytochrome c  33.52 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  34.64 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  34.5 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  32.93 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35390  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  35.06 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  0.0513213 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>