More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0197 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  100 
 
 		 206 aa  424  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  70.43 
 
 		 205 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  44.77 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0546  cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 249 aa  144  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  41.67 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  42.51 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  42.51 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  40.51 
 
 		 265 aa  135  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  41.71 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  41.71 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  41.71 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  41.71 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  41.71 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  41.71 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  39.49 
 
 		 545 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  40.68 
 
 		 217 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  40.68 
 
 		 217 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  40.68 
 
 		 217 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  40.68 
 
 		 217 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  40.22 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  38.07 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  40.11 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  39.55 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  39.55 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  37.56 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  40 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  40 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  40 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  38.73 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 207 aa  118  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  35.03 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  36.97 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  38.01 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  36.26 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  36.26 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  36.42 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 219 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  36.84 
 
 		 217 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  36.76 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  34.55 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  37.57 
 
 		 212 aa  111  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  32.04 
 
 		 205 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  41.52 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  35.76 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  32.04 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  34.3 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  35.84 
 
 		 255 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  40 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  40 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  32.04 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  32.04 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0670  cytochrome c553  34.67 
 
 		 205 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.680454  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  32.99 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  35.43 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  34.64 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  35.56 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  35.84 
 
 		 242 aa  105  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  32.95 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  37.58 
 
 		 219 aa  104  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  38.82 
 
 		 223 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  37 
 
 		 220 aa  104  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  32.52 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  34.55 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  34.24 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  32.58 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  32.31 
 
 		 200 aa  102  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  30.85 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  32.95 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  32.04 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  37.87 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 222 aa  101  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  35.75 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  33.51 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  35.43 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  31.88 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0820  cytochrome c4 family protein  74.63 
 
 		 109 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.757311  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  30.35 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  32.51 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  38.07 
 
 		 256 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  32.58 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  30.73 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1585  cytochrome c4 family protein  74.63 
 
 		 74 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0036  cytochrome c4 family protein  74.63 
 
 		 74 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00554051  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  37.79 
 
 		 236 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2984  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  31.75 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  30.58 
 
 		 229 aa  99  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  31.22 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  31.22 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  31.22 
 
 		 207 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0943  putative cytochrome c  71.64 
 
 		 80 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  31.86 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  33.71 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  37.21 
 
 		 249 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  37.21 
 
 		 253 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>