259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0036 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0820  cytochrome c4 family protein  100 
 
 		 109 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.757311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0036  cytochrome c4 family protein  100 
 
 		 74 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00554051  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1585  cytochrome c4 family protein  100 
 
 		 74 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474083  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0943  putative cytochrome c  94.59 
 
 		 80 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2195  cytochrome c4 family protein  92.5 
 
 		 115 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000233846  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0850  putative cytochrome c  96.88 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.177794  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  91.04 
 
 		 205 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  74.63 
 
 		 206 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  48.48 
 
 		 230 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  48.53 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  42.65 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  48.48 
 
 		 230 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  48.48 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  46.97 
 
 		 242 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  44.62 
 
 		 246 aa  60.5  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  45.45 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  49.23 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0690  cytochrome c class I  46.97 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0729078  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  47.89 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0710  cytochrome c, class I  46.97 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.272303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  45.59 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  47.89 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  44.78 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  44.93 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  43.94 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  46.48 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  43.06 
 
 		 205 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  43.75 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  43.75 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  52.83 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  46.03 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  47.06 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  44.62 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  43.06 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  45.59 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  43.48 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  46.55 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  43.06 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  42.03 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  45.59 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  43.06 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  41.54 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  43.06 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  46.48 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  43.06 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  44.62 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  43.06 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  39.71 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  44.62 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  48.21 
 
 		 223 aa  53.9  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  41.67 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  44.78 
 
 		 217 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  43.75 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  46.88 
 
 		 207 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  43.06 
 
 		 215 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  43.06 
 
 		 265 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  47.69 
 
 		 265 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  40 
 
 		 201 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  40 
 
 		 219 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  43.06 
 
 		 265 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  40 
 
 		 222 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  43.06 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  43.08 
 
 		 219 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 220 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  36.36 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  37.14 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  43.94 
 
 		 216 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  41.54 
 
 		 219 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  43.06 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  43.06 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  43.06 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  37.14 
 
 		 201 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  43.28 
 
 		 210 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  35.29 
 
 		 206 aa  51.6  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  35.71 
 
 		 210 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  40.58 
 
 		 227 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  43.06 
 
 		 545 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  39.39 
 
 		 208 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  40.3 
 
 		 205 aa  50.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  39.39 
 
 		 208 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  39.39 
 
 		 208 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  39.39 
 
 		 208 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  40.91 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  38.1 
 
 		 199 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  43.28 
 
 		 217 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  43.48 
 
 		 373 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 202 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  41.79 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0670  cytochrome c553  45.45 
 
 		 205 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.680454  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  42.42 
 
 		 213 aa  50.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  46.51 
 
 		 205 aa  50.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  44.19 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2984  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  38.81 
 
 		 218 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  41.89 
 
 		 267 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  38.81 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35390  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  41.79 
 
 		 215 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  0.0513213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  39.39 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>