More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4355 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  100 
 
 
223 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  96.86 
 
 
223 aa  440  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  96.86 
 
 
223 aa  440  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  59.17 
 
 
292 aa  245  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  51.83 
 
 
218 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  49.08 
 
 
218 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  50.92 
 
 
219 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  50.46 
 
 
219 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  50.46 
 
 
219 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  48.15 
 
 
218 aa  187  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  46.67 
 
 
218 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  37.56 
 
 
226 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  42.11 
 
 
168 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  37.2 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  42.26 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  37.8 
 
 
205 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  36.11 
 
 
179 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  38.82 
 
 
205 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  37.99 
 
 
198 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  37.87 
 
 
206 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  34.57 
 
 
200 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  39.76 
 
 
221 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  37.43 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  34.78 
 
 
196 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  38.59 
 
 
212 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  38.75 
 
 
188 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  37.35 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  37.95 
 
 
219 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  35.26 
 
 
213 aa  95.5  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  35.26 
 
 
213 aa  95.5  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  37.13 
 
 
200 aa  95.1  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  39.63 
 
 
318 aa  95.1  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  34.85 
 
 
230 aa  95.1  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  34.85 
 
 
230 aa  95.1  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  33.94 
 
 
206 aa  94.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  39.41 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  39.41 
 
 
254 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  39.41 
 
 
236 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  39.41 
 
 
254 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  38.82 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  38.82 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  38.04 
 
 
193 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  38.37 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  33.73 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  35.11 
 
 
260 aa  92.4  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  35.75 
 
 
207 aa  92.8  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  36.78 
 
 
217 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  38.15 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  35.42 
 
 
220 aa  92.4  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  38.15 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  38.15 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  35.11 
 
 
234 aa  91.7  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  36.2 
 
 
191 aa  92  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  36.21 
 
 
217 aa  91.7  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  36.09 
 
 
243 aa  91.7  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  38.24 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  35.32 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  38.15 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  38.15 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  38.15 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  38.15 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  34.29 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  36.9 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  34.25 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  35.5 
 
 
243 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  36.9 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  33.53 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  36.9 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  36.9 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  36.9 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  36.9 
 
 
249 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  36.9 
 
 
249 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  35.59 
 
 
217 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  35.03 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  35.03 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  32.58 
 
 
205 aa  89.4  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  35.84 
 
 
207 aa  89  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  35.59 
 
 
204 aa  89  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2984  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  31.17 
 
 
218 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  37.71 
 
 
209 aa  88.2  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  35.03 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  32.79 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  32.95 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  34.3 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  32.02 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  37.06 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  36.42 
 
 
207 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  34.59 
 
 
256 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  34.71 
 
 
207 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  35.47 
 
 
206 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  36.65 
 
 
266 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  37.7 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  36.42 
 
 
199 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  38.01 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  32.6 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  35.75 
 
 
226 aa  85.9  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  37.06 
 
 
243 aa  85.9  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  34.04 
 
 
238 aa  85.9  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  36.99 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  30.7 
 
 
206 aa  85.5  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>