More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1779 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  68.21 
 
 
206 aa  261  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  44.77 
 
 
212 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  42.93 
 
 
230 aa  155  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  42.93 
 
 
230 aa  155  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0546  cytochrome c, class I  49.32 
 
 
249 aa  152  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  41.8 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  41.8 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  39.13 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  41.81 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  41.14 
 
 
265 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  41.14 
 
 
215 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  41.14 
 
 
206 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  41.14 
 
 
206 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  41.14 
 
 
206 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  41.14 
 
 
265 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  41.81 
 
 
217 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  41.81 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  41.81 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  41.81 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0820  cytochrome c4 family protein  91.04 
 
 
109 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.757311  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  40.35 
 
 
219 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  41.24 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  40.35 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1585  cytochrome c4 family protein  91.04 
 
 
74 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  41.14 
 
 
545 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0036  cytochrome c4 family protein  91.04 
 
 
74 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00554051  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  41.24 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  40.78 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  36.53 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0943  putative cytochrome c  88.06 
 
 
80 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  41.57 
 
 
255 aa  124  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  39.55 
 
 
217 aa  124  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  40 
 
 
260 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  39.88 
 
 
208 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0850  putative cytochrome c  90.62 
 
 
127 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.177794  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  40 
 
 
234 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  38.98 
 
 
217 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2195  cytochrome c4 family protein  90.62 
 
 
115 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000233846  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  38.6 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  38.73 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  36.36 
 
 
246 aa  118  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  36.54 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  36.26 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  36.26 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  38.55 
 
 
223 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  36.14 
 
 
225 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  34.85 
 
 
209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  35.38 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  36.36 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  35.84 
 
 
203 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  37.95 
 
 
212 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  33.97 
 
 
205 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  33.49 
 
 
205 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  35.67 
 
 
207 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  36.76 
 
 
242 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  36.69 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  33.97 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  33.97 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  36.7 
 
 
226 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  35.76 
 
 
219 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  32.95 
 
 
210 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  35.43 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  38.85 
 
 
219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  34.27 
 
 
206 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  35.26 
 
 
209 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  35.8 
 
 
205 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  30.97 
 
 
227 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  35.76 
 
 
238 aa  106  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  35.35 
 
 
223 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  35.21 
 
 
207 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  31.67 
 
 
221 aa  102  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  34.74 
 
 
206 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2984  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  32.5 
 
 
218 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  38.6 
 
 
223 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  38.6 
 
 
223 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  35.8 
 
 
211 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  33.8 
 
 
207 aa  101  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  33.15 
 
 
214 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  32.69 
 
 
202 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  35.68 
 
 
207 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  37.87 
 
 
219 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  35.68 
 
 
207 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  35.68 
 
 
207 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  35.68 
 
 
207 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  37.21 
 
 
220 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  37.87 
 
 
219 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  37.28 
 
 
219 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0670  cytochrome c553  33.33 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.680454  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  34.74 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  37.43 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  34.74 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  31.75 
 
 
205 aa  99  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  34.74 
 
 
207 aa  99  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  31.22 
 
 
205 aa  99  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35390  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  32.29 
 
 
215 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  0.0513213 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  30.48 
 
 
206 aa  98.2  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0690  cytochrome c class I  36.91 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0729078  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  34.46 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  32.38 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>