More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3138 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  44.57 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  44.94 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  44.79 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  43.48 
 
 		 217 aa  144  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  42.93 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  42.93 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  42.93 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  42.94 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  42.39 
 
 		 217 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  42.39 
 
 		 217 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  44.44 
 
 		 205 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  41.85 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  38.25 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  39.9 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  41.05 
 
 		 265 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  40.12 
 
 		 205 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  39.79 
 
 		 217 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  42.7 
 
 		 209 aa  134  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  40.44 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  40.44 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  40.44 
 
 		 265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  40.44 
 
 		 265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  40.44 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  40.44 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  39.79 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  40.44 
 
 		 545 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  39.79 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  35.32 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  43.64 
 
 		 222 aa  128  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  37.13 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  38.98 
 
 		 225 aa  124  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  40.61 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  39.55 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  38.42 
 
 		 209 aa  121  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  38.98 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  39.55 
 
 		 255 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  38.79 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  37.93 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  35.96 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  41.76 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  39.52 
 
 		 318 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  37.72 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  40 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  36.11 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  40 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  38.92 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  40.44 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  37.85 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  35.21 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  35.48 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  36.06 
 
 		 207 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  36.06 
 
 		 207 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  36.06 
 
 		 207 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  33.85 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  39.29 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0710  cytochrome c, class I  40.33 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.272303 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  35.21 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0690  cytochrome c class I  40.33 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0729078  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  37.13 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  37.5 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  38.69 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  38.69 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  39.88 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  37.72 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  38.69 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  37.5 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  38.82 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  36.63 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  35.85 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  37.7 
 
 		 220 aa  111  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  37.36 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  37.36 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  35.03 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  35.07 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  34.48 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  37.36 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  36.87 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  38.32 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  34.48 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  34.27 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  38.41 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  38.41 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  36.63 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  33.96 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3403  cytochrome c class I  31.77 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.670594  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  37.8 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  33.65 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  30.95 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  35.44 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  37.65 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  32.58 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>