More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6834 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  100 
 
 
218 aa  447  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  63.18 
 
 
219 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  63.18 
 
 
219 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  63.18 
 
 
219 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  56.88 
 
 
218 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  53.99 
 
 
218 aa  237  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  48.22 
 
 
292 aa  185  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  46.67 
 
 
223 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  46.67 
 
 
223 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  46.67 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  43.33 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  40.65 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  45.7 
 
 
168 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  39.13 
 
 
200 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  39.62 
 
 
196 aa  124  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  38.51 
 
 
179 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  38.12 
 
 
206 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  42.01 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  38.85 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  38.37 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  36.74 
 
 
212 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  37.79 
 
 
200 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  36.47 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  38.6 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  38.42 
 
 
204 aa  108  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  36.63 
 
 
205 aa  108  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  39.08 
 
 
212 aa  108  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  37.8 
 
 
198 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  37.57 
 
 
206 aa  104  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  38.5 
 
 
207 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  38.5 
 
 
207 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  38.5 
 
 
207 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  37.72 
 
 
216 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  37 
 
 
207 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  37.99 
 
 
226 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  37.5 
 
 
207 aa  102  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  34.86 
 
 
208 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  33.9 
 
 
210 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  34.86 
 
 
208 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  34.86 
 
 
208 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  39.08 
 
 
207 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  39.08 
 
 
207 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  39.08 
 
 
207 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  39.08 
 
 
207 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  37.21 
 
 
196 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  37.21 
 
 
201 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  34.81 
 
 
205 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  36.99 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  34.86 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  35.68 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  32.37 
 
 
237 aa  99.8  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  36.14 
 
 
246 aa  99.4  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  35.93 
 
 
216 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  35.29 
 
 
238 aa  99  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  34.25 
 
 
205 aa  99  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  36.26 
 
 
200 aa  98.6  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  34.29 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  39.64 
 
 
208 aa  98.6  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  37.93 
 
 
219 aa  98.6  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  37.93 
 
 
217 aa  98.6  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  34.29 
 
 
208 aa  98.6  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  37.72 
 
 
217 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  35.96 
 
 
223 aa  98.2  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  37.58 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  34.27 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  37.72 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  35.43 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  33.51 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  34 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  36.93 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  36.97 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  37.5 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  34.24 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  34.09 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  34.24 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  37.28 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  33.64 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  34.66 
 
 
208 aa  95.1  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  37.64 
 
 
215 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  36.69 
 
 
213 aa  94.7  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  37.64 
 
 
265 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  35.63 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  38.2 
 
 
265 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  37.64 
 
 
265 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  36.69 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  33.7 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  37.64 
 
 
206 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  37.64 
 
 
545 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  37.64 
 
 
206 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  37.64 
 
 
206 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  35.76 
 
 
193 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  37.69 
 
 
262 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  33.73 
 
 
209 aa  92.4  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  37.06 
 
 
255 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  34.1 
 
 
206 aa  92  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  33.18 
 
 
219 aa  91.7  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  35.03 
 
 
203 aa  92  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  34.73 
 
 
222 aa  91.7  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  36.9 
 
 
205 aa  91.7  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  34.68 
 
 
202 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>