194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1665 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  100 
 
 		 104 aa  206  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  48.54 
 
 		 101 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  53.09 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  49.35 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  48.31 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  48.96 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  50 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  50 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  50.67 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  47.89 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  46.38 
 
 		 213 aa  70.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  43.9 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  37.23 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  38.3 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  41.46 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  41.43 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  39.76 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  43.48 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  33.72 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  35.71 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  38.03 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  30 
 
 		 212 aa  62  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  37.93 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  36.62 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  40.3 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  37.21 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  40.58 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  40 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  39.39 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  40.85 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  31.18 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  40.91 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  36.62 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  41.27 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  34.72 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  35.11 
 
 		 318 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  32.18 
 
 		 224 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 239 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  39.39 
 
 		 199 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  30.56 
 
 		 266 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0445  hypothetical protein  43.75 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  36.11 
 
 		 237 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  33.8 
 
 		 214 aa  50.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  44.29 
 
 		 226 aa  50.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  30.56 
 
 		 269 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  39.24 
 
 		 257 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  35.62 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 269 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  30.56 
 
 		 262 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  30.56 
 
 		 262 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  33.98 
 
 		 105 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  33.98 
 
 		 105 aa  49.7  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  31.94 
 
 		 262 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  31.68 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4954  Cytochrome c553-like protein  28.17 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0669  hypothetical protein  34.26 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0140591  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  37.97 
 
 		 261 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  33.98 
 
 		 105 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  30.56 
 
 		 262 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  35.06 
 
 		 213 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1404  cytochrome c, class I  29.17 
 
 		 263 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4365  cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  29.58 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 269 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 220 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  36.76 
 
 		 226 aa  48.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  32.88 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 236 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3048  cytochrome c553  33.33 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.58659  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  28.74 
 
 		 382 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1724  hypothetical protein  36.99 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.751234  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  35.8 
 
 		 240 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  31.43 
 
 		 206 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 256 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  33.93 
 
 		 220 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  30.56 
 
 		 222 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 205 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  36.84 
 
 		 284 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  28.99 
 
 		 271 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  40 
 
 		 273 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 230 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  33.78 
 
 		 203 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  36.36 
 
 		 230 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  33.33 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  31.43 
 
 		 216 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  32.39 
 
 		 227 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  30.95 
 
 		 239 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  31.43 
 
 		 217 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  31.18 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  32.89 
 
 		 201 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  30 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  33.85 
 
 		 222 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  31.33 
 
 		 243 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>