119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0237 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  100 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  45.56 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  52 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  35.24 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  45.71 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  33.93 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  35.29 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  41.1 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  44.58 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  41.43 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  35.35 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  37.68 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  31.91 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  40.3 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  35.58 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  41.57 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  35.37 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  39.51 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  41.43 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  39.19 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  36.23 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  32.65 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  41.43 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  31.46 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  29.33 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  32.5 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  40.54 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  35.71 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  40.54 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  34.65 
 
 		 115 aa  50.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4249  putative cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  34.41 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.22639 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  36.23 
 
 		 237 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  30.48 
 
 		 216 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  34.44 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  36.9 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0006  monoheme cytochrome c  28.75 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  30.53 
 
 		 217 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  37.89 
 
 		 227 aa  48.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  33.67 
 
 		 221 aa  48.9  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  28.87 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0006  monoheme cytochrome c  28.75 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  37.88 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  37.5 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1112  hypothetical protein  37.78 
 
 		 51 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.527816 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0006  monoheme cytochrome c  28.75 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0714  monoheme cytochrome c  31.75 
 
 		 100 aa  47.4  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  32.32 
 
 		 198 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4954  Cytochrome c553-like protein  31.11 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4365  cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  33.33 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  28.16 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 262 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  32 
 
 		 216 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3048  cytochrome c553  43.94 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.58659  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  37.31 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1799  cytochrome c family protein  35.21 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000599943  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  32 
 
 		 318 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  31.17 
 
 		 213 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  33 
 
 		 256 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  37.8 
 
 		 220 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  42.65 
 
 		 205 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  32.32 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  32.47 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  29.29 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  33.82 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  32.18 
 
 		 267 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  31.31 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  38.57 
 
 		 206 aa  44.3  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 226 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  32.43 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  32.18 
 
 		 228 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  28.99 
 
 		 236 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  30.93 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  31.25 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 226 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  29.9 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  29.52 
 
 		 225 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  31.52 
 
 		 229 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  30.68 
 
 		 418 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  39.71 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5446  putative cytochrome c4 precursor  36.84 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 269 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00326  cytochrome C4  22.99 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  29.79 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  29.49 
 
 		 262 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  29.49 
 
 		 262 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  29.49 
 
 		 262 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  31.78 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1176  cytochrome c class I  29.23 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000869093 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 192 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 255 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1635  putative cytochrome  25.68 
 
 		 129 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.240566  normal  0.477632 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>