126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0729 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  224  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1112  hypothetical protein  82.35 
 
 		 51 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.527816 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  45.45 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  49.25 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  46.99 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  49.25 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  50 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  47.14 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  38.3 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  47.83 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  41.54 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  47.83 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  36.7 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  34.48 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  36.78 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  30 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  36.25 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  31.91 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  37.31 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  42.25 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  35.82 
 
 		 217 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  43.48 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  37.31 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  42.03 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  35.53 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  42.19 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  37.88 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  34.38 
 
 		 216 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1724  hypothetical protein  38.89 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.751234  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  28.44 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  33.71 
 
 		 226 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  28.3 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  36 
 
 		 223 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0669  hypothetical protein  34.33 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0140591  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  35.94 
 
 		 222 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  32.81 
 
 		 213 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  32.86 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  38.81 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  34.72 
 
 		 222 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  32.39 
 
 		 221 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  33.82 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  35.21 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  28.87 
 
 		 318 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  33.02 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  32.81 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  35.82 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  31.71 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 225 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  33.82 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  33.33 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  31.71 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  29.41 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  36.62 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  32.84 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  34.38 
 
 		 271 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  25.96 
 
 		 237 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  30.43 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0575  cytochrome c553  31.51 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.673779  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  33.85 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  36.11 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  40 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  30.88 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  35.21 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  35.9 
 
 		 418 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  41.27 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  40.82 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  26.97 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  31.51 
 
 		 100 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  24.78 
 
 		 256 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1821  cytochrome c-553  32.43 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000401467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  26.42 
 
 		 109 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  31.51 
 
 		 100 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  27.47 
 
 		 100 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  32.56 
 
 		 281 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  32.39 
 
 		 106 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  30.14 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  28.7 
 
 		 238 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  28.7 
 
 		 238 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0445  hypothetical protein  32.31 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  28.38 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  28.7 
 
 		 236 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  28.7 
 
 		 236 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  36.23 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  36.23 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3823  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.89 
 
 		 325 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  36.23 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  32 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  32.81 
 
 		 229 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  33.78 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3576  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.71 
 
 		 326 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3048  cytochrome c553  32.84 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.58659  normal  0.0282506 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>