More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1085 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  100 
 
 		 105 aa  214  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  100 
 
 		 105 aa  214  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  100 
 
 		 105 aa  214  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  68.27 
 
 		 104 aa  136  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  49.04 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  50.96 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  51.43 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  50.48 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  46.3 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  53.93 
 
 		 205 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  50.47 
 
 		 223 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  47.06 
 
 		 200 aa  94  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  52.81 
 
 		 205 aa  93.6  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  45.1 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  48.54 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  45.28 
 
 		 205 aa  91.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  46 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  46.32 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  40.57 
 
 		 207 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  40.57 
 
 		 207 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  40.57 
 
 		 207 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  39.62 
 
 		 207 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  39.62 
 
 		 207 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  39.62 
 
 		 207 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  39.62 
 
 		 207 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3651  cytochrome c, class I  60.24 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  38.89 
 
 		 207 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  50.62 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  53.16 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  38.68 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  37.74 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  42.57 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  39.62 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  44.04 
 
 		 229 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  38.68 
 
 		 206 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  37.74 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  40.38 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  43.48 
 
 		 318 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  47.56 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  40.57 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  45.45 
 
 		 200 aa  77  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 206 aa  77  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  45.45 
 
 		 200 aa  76.6  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  41.28 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  48.05 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  37.61 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3403  cytochrome c class I  40.74 
 
 		 266 aa  74.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.670594  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  43.4 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  40.2 
 
 		 193 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  41.28 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  38.32 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  38.32 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  39.64 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04432  cytochrome C4  36.36 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  38.32 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  39.64 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  41.98 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  37.38 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  38.18 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  47.62 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  33.98 
 
 		 221 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  36.73 
 
 		 202 aa  70.5  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  42.47 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  43.02 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  43.59 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  50 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  40.38 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  43.21 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  35.51 
 
 		 221 aa  67  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  47.14 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  40.74 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  42.11 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  41.89 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  40 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  35.29 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  35.29 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  40 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  40 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  35 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0391  cytochrome c, class I  45.16 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.401855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  47.89 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  36.89 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  42.35 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1859  cytochrome c family protein  39.24 
 
 		 324 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  39 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0848  cytochrome C4 family protein  41.46 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1332  cytochrome c, class IC  41.46 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0014287  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1017  cytochrome c, class IC  41.46 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0966  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  41.46 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1179  cytochrome c family protein  41.46 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0300  cytochrome c, class IC  41.46 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>