129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0538 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  100 
 
 		 102 aa  201  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  72.82 
 
 		 103 aa  137  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1821  cytochrome c-553  55.34 
 
 		 103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000401467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  51.85 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0741  cytochrome c, class I  41.76 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0335  cytochrome c, class I  35.64 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  38.83 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  39.22 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0578  cytochrome c-553  41.58 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00244376  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1543  cytochrome c-553  43.01 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.31178  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0739  putative cytochrome c  34.65 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0127  cytochrome c class I  32.98 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  38.96 
 
 		 192 aa  57  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  37.23 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  32.43 
 
 		 217 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0575  cytochrome c553  37.74 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.673779  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0241  cytochrome c-553 (cytochrome c553) (low-potential cytochromec)  36.54 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  32.43 
 
 		 216 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  38.36 
 
 		 219 aa  51.2  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  38.36 
 
 		 219 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  37.74 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  37.74 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  39.47 
 
 		 230 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  30.12 
 
 		 214 aa  50.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  29.63 
 
 		 318 aa  50.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1570  cytochrome c, class I  35 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0285899  normal  0.683196 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  32.94 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 216 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0474  cytochrome c family protein  36.19 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 225 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  39.73 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  32.88 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  34.67 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  35.05 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  26.97 
 
 		 205 aa  47.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  35.62 
 
 		 224 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  32.39 
 
 		 207 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  32.88 
 
 		 222 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  31.71 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  26.25 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  27.78 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  32.89 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  35.06 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  34.25 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  32.86 
 
 		 211 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  26.74 
 
 		 206 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  30.67 
 
 		 224 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1418  cytochrome c553  31.78 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.785663  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  29.58 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  28.28 
 
 		 269 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  32.47 
 
 		 287 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  33.77 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  29.07 
 
 		 212 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  28.71 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1108  hypothetical protein  30.68 
 
 		 248 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  27.27 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  31.25 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  37.66 
 
 		 262 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  27.27 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  27.93 
 
 		 216 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  37.66 
 
 		 262 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1235  cytochrome c553  33.72 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  37.66 
 
 		 262 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  32.88 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1416  cytochrome c553  28.97 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  37.66 
 
 		 262 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  27.78 
 
 		 271 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  32.88 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  32.18 
 
 		 202 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  32 
 
 		 382 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  32.88 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  32.88 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  32.88 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  29.21 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  33.65 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  32.88 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  33.65 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  33.65 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  26.74 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  32.88 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  30.56 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  29.17 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  32.39 
 
 		 220 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  34.25 
 
 		 265 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  30.99 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  35.21 
 
 		 228 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  35.21 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0908  cytochrome c, class I  30.09 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.413276  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0431  cytochrome c class I  36.94 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  5.40538e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  35.06 
 
 		 266 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  30.99 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  29.58 
 
 		 200 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  30.56 
 
 		 269 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  28.21 
 
 		 228 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 212 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>