236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0009 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  100 
 
 		 124 aa  256  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  67.2 
 
 		 126 aa  167  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  74.68 
 
 		 123 aa  130  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  57.02 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  53.33 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  48.41 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  43.21 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  43.24 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  33.93 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  44.93 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  43.24 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  46.38 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  38 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  36.14 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  41.89 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  43.66 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  37.35 
 
 		 212 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  38.67 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  38.16 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4249  putative cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  38.46 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.22639 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  41.1 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  32.2 
 
 		 116 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  36.62 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  37.21 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  33.78 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  43.48 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  37.88 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4954  Cytochrome c553-like protein  38.16 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  36.67 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  42.03 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  34.07 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  35.44 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  37.08 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  40 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  39.74 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  36.71 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  38.04 
 
 		 217 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  41.18 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 216 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4365  cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  37.18 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  34.25 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  36.71 
 
 		 318 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  36.56 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  37.18 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 196 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  35.71 
 
 		 217 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 240 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 216 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  33.68 
 
 		 217 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  38.03 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  32.04 
 
 		 199 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  31.11 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  34.72 
 
 		 200 aa  50.4  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1404  cytochrome c, class I  31.65 
 
 		 263 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 257 aa  50.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  34.78 
 
 		 261 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  34.52 
 
 		 270 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  34.74 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  31.76 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  38.57 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  36.25 
 
 		 223 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  34.29 
 
 		 239 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  37.84 
 
 		 292 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  30.77 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  30.21 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  32.1 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 216 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  35.21 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  39.06 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  32 
 
 		 266 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  34.78 
 
 		 284 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  32.04 
 
 		 238 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  40 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  31.11 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  32.04 
 
 		 236 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  32.04 
 
 		 236 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  35.71 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  34.92 
 
 		 209 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  32.04 
 
 		 238 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  31.33 
 
 		 207 aa  47.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  31.33 
 
 		 207 aa  47.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  28.26 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  35.23 
 
 		 219 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  32.88 
 
 		 205 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  36.23 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 225 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  31.65 
 
 		 206 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  29.27 
 
 		 206 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  31.33 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  31.33 
 
 		 207 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>