247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1476 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  100 
 
 		 109 aa  216  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  52 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  61.54 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  51 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  45.54 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  51.22 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  47.62 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  43.59 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  43.75 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  46.67 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  44.3 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  42.5 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  37.25 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  41.18 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  36.89 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  36 
 
 		 222 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  44.93 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  34.91 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  31.68 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  41.79 
 
 		 228 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  39.29 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  44.29 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  36.08 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  36.25 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  36.23 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  41.43 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  35.29 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  40 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  34.72 
 
 		 226 aa  53.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  37.31 
 
 		 230 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  37.31 
 
 		 230 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  38.24 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  34.23 
 
 		 238 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  34.23 
 
 		 238 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  40.58 
 
 		 236 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  43.28 
 
 		 261 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  40.58 
 
 		 236 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  33.66 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  36.23 
 
 		 216 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 243 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  35.24 
 
 		 235 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  39.13 
 
 		 243 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  37.88 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  37.14 
 
 		 217 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  31.65 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  38.57 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  33.65 
 
 		 220 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 239 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  37.68 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  37.33 
 
 		 213 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  32.47 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  35.79 
 
 		 318 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  40.3 
 
 		 257 aa  50.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  41.79 
 
 		 284 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 196 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  43.94 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  34.62 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  35.14 
 
 		 205 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  38.57 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  40.58 
 
 		 292 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  36.9 
 
 		 201 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  33.78 
 
 		 218 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  33.78 
 
 		 218 aa  50.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  34.78 
 
 		 208 aa  50.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  37.21 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  38.81 
 
 		 206 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  37.11 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  33.8 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  32.98 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  34.02 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  38.55 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  38.81 
 
 		 239 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  35.58 
 
 		 235 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  34.12 
 
 		 205 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  31.43 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  35.23 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  38.57 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  36.45 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  38.57 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  37.8 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  36.76 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  36.49 
 
 		 200 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  37.8 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0542  putative cytochrome c  35.29 
 
 		 208 aa  48.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  43.42 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 226 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 227 aa  48.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  38.03 
 
 		 226 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  37.8 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  34.15 
 
 		 253 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  32.43 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  34.15 
 
 		 253 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  36.49 
 
 		 243 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  34.15 
 
 		 253 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  34.15 
 
 		 234 aa  47.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>