94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3047 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  54.08 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  45.19 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  37.5 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  44.59 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  44.04 
 
 		 212 aa  72  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  47.22 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  45.21 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  42.86 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  38.53 
 
 		 213 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  37.84 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  45.95 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  41.89 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  41.3 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  40.26 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  37.04 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  45.33 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  42.65 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  38.36 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  35.56 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  37.25 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  37.88 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  37.18 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  37.62 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  32.47 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  40.51 
 
 		 225 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  37.36 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  34.41 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  33.33 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  29.25 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  34.65 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  34.83 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  42.25 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  40.3 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  34.29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  41.43 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  32 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 179 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  31.18 
 
 		 206 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  36.84 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  30.69 
 
 		 196 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  36.23 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  38.95 
 
 		 209 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  38.89 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 214 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  35.16 
 
 		 191 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  38.36 
 
 		 236 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  35.82 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4249  putative cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  34.74 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.22639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  36 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  29.91 
 
 		 227 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  33.8 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  29.85 
 
 		 222 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 265 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  32.35 
 
 		 195 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  30.67 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  33.67 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  32.05 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  32.05 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  28.3 
 
 		 108 aa  42.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  32.05 
 
 		 545 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  32.05 
 
 		 265 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  32.05 
 
 		 265 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  32.05 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 237 aa  42.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  33.66 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  32.05 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  34.38 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4954  Cytochrome c553-like protein  31.58 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1635  putative cytochrome  28.21 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.240566  normal  0.477632 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  30.88 
 
 		 239 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  34.72 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 153 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  35.38 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  30.28 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  29.25 
 
 		 211 aa  40.8  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1799  cytochrome c family protein  31.88 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000599943  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  33.75 
 
 		 213 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1112  hypothetical protein  38.64 
 
 		 51 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.527816 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  35.38 
 
 		 207 aa  40.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 243 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  29.41 
 
 		 243 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  30.56 
 
 		 318 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  29.63 
 
 		 253 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1173  cytochrome c class I  30.26 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000726448 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0546  cytochrome c, class I  29.11 
 
 		 249 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>