233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1738 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  100 
 
 		 103 aa  213  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  57.83 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  43.62 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  36.63 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  45.56 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  48.68 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  48.65 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  46.58 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  47.83 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  50 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  43.21 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  43.84 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  49.3 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  41.67 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  43.14 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  42.35 
 
 		 212 aa  70.5  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  41 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  37.04 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  42.25 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  44.12 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  51.43 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  43.59 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  41.54 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  38.38 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  46.99 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  46.67 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  40.85 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  46.27 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  38.82 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  36 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  44.29 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  34.04 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  39.58 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  41.79 
 
 		 292 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  32.18 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  36.99 
 
 		 266 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  32.18 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  45.45 
 
 		 265 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  31.37 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  31.37 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  31.37 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  43.94 
 
 		 215 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  43.94 
 
 		 265 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  43.94 
 
 		 265 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  43.94 
 
 		 545 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  43.94 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  43.94 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  43.94 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  35.71 
 
 		 217 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  37.84 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  36.78 
 
 		 236 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  39.71 
 
 		 216 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  31.73 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  35.8 
 
 		 270 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  34.88 
 
 		 212 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  30.3 
 
 		 216 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  34.78 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1112  hypothetical protein  39.58 
 
 		 51 aa  50.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.527816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  37.31 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  38.24 
 
 		 208 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  38.24 
 
 		 208 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  38.24 
 
 		 208 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  38.24 
 
 		 208 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  36.76 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  32 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  36.49 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  32.53 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0546  cytochrome c, class I  35.62 
 
 		 249 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  38.24 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  31.52 
 
 		 226 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  38.24 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  32.53 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4954  Cytochrome c553-like protein  30.77 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 209 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  32.26 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  43.48 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  38.57 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  33.02 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  38.81 
 
 		 238 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  33.33 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  34.62 
 
 		 202 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  34.69 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  31.52 
 
 		 238 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  36.76 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  33.67 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  35.56 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 214 aa  48.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  34.51 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  31.13 
 
 		 206 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 255 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 242 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  36.76 
 
 		 203 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  34.12 
 
 		 267 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  34.78 
 
 		 262 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>