More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0313 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  100 
 
 		 100 aa  201  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  54.37 
 
 		 108 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  63.41 
 
 		 318 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  66.67 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  51.92 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  55.17 
 
 		 98 aa  103  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  47.62 
 
 		 206 aa  97.1  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  50 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  54.55 
 
 		 200 aa  92.8  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  44.66 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  45.71 
 
 		 206 aa  92  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  47.62 
 
 		 206 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  43.93 
 
 		 206 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  45.19 
 
 		 205 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  45.19 
 
 		 205 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  45.19 
 
 		 205 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  46.23 
 
 		 207 aa  90.1  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  44.44 
 
 		 207 aa  90.1  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  51.72 
 
 		 200 aa  90.1  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  45.28 
 
 		 207 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  45.28 
 
 		 207 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  45.28 
 
 		 207 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  50.57 
 
 		 200 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  45.28 
 
 		 207 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  44 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  45.28 
 
 		 207 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  45.28 
 
 		 207 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  45.28 
 
 		 207 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  57.14 
 
 		 205 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  43.81 
 
 		 206 aa  87.8  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  51.04 
 
 		 223 aa  87.8  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  47.92 
 
 		 205 aa  88.2  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  44.23 
 
 		 205 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  47.37 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  43.93 
 
 		 207 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  41.58 
 
 		 198 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  46 
 
 		 201 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  42.06 
 
 		 206 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  52.5 
 
 		 196 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  52.94 
 
 		 205 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  52.94 
 
 		 205 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  48 
 
 		 203 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  50.68 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  48.75 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  42 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  45.28 
 
 		 207 aa  84  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  52.56 
 
 		 206 aa  84.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  46.79 
 
 		 220 aa  83.6  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  45.92 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1173  cytochrome c class I  55.38 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000726448 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  58.44 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  43.27 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  43.27 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  43.27 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  45.71 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  42.86 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  45.71 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  50.63 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  50 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  40 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  56.92 
 
 		 208 aa  77.4  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  52.94 
 
 		 200 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0979  cytochrome c class I  41.94 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0035019  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  46.05 
 
 		 202 aa  77  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  42.27 
 
 		 202 aa  77  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  40 
 
 		 212 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  48.39 
 
 		 205 aa  77  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  39.18 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  50 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  45.54 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  45.95 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  43.81 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  43.75 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  50 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  50 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  46.67 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0009  monoheme cytochrome c  43.21 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00972927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  47.06 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  50 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0009  cytochrome c class I  43.21 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000357526 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  46.67 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3651  cytochrome c, class I  56.12 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  51.43 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0009  monoheme cytochrome c  43.21 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  38.78 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  48.57 
 
 		 223 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  51.32 
 
 		 209 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  48.81 
 
 		 217 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  48.81 
 
 		 217 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0006  monoheme cytochrome c  42.05 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  52.7 
 
 		 212 aa  73.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  46.58 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  50.75 
 
 		 242 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  47.44 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  38.46 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  49.28 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  39.62 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0717  monoheme cytochrome c  44.16 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  48.65 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  48.81 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>