150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0626 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  100 
 
 		 106 aa  213  9e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  51.61 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  51.39 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  47.95 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  37.84 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  43.24 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  43.06 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  46.38 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  46.67 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  48.61 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  47.95 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  51.35 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  39.19 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  43.48 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  45.21 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  44.12 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  38.89 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  46.38 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  38.37 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  46.97 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  37.72 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  37.89 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  38.57 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  36.9 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  35.71 
 
 		 118 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  41.79 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  42.67 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  33.75 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4249  putative cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  37.23 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.22639 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  40.3 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  42.19 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4954  Cytochrome c553-like protein  35.37 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5446  putative cytochrome c4 precursor  34.04 
 
 		 196 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  36 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  38.24 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 318 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  40.58 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  32.94 
 
 		 226 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  32.98 
 
 		 200 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  37.5 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  39.71 
 
 		 203 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  29.58 
 
 		 212 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  40 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  30.14 
 
 		 206 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  35.35 
 
 		 202 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  30.69 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 226 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 211 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  32.88 
 
 		 255 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1404  cytochrome c, class I  34.38 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  32.11 
 
 		 265 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4365  cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  34.21 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  32.86 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 222 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  32.58 
 
 		 222 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  31.76 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  29.17 
 
 		 222 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  35.21 
 
 		 256 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  38.24 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  33.75 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0445  hypothetical protein  29.73 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  34.92 
 
 		 270 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  31.76 
 
 		 265 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  32.86 
 
 		 212 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  31.76 
 
 		 265 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  31.76 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  31.76 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  31.76 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  36.36 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 200 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  35.14 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  35.14 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  31.76 
 
 		 217 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  36.67 
 
 		 206 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  38.03 
 
 		 220 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  32.81 
 
 		 269 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  34.31 
 
 		 284 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  35.14 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  34.78 
 
 		 208 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  32.53 
 
 		 545 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  31.96 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  37.89 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  40.91 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  39.44 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  32.35 
 
 		 217 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  32.22 
 
 		 207 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  37.68 
 
 		 205 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  31.13 
 
 		 205 aa  43.5  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  38.03 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3048  cytochrome c553  35.29 
 
 		 99 aa  42.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.58659  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 269 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  30.61 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  31.87 
 
 		 236 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  34.72 
 
 		 237 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  37.31 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>