More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6830 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  100 
 
 
292 aa  588  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  60.09 
 
 
223 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  59.46 
 
 
223 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  59.46 
 
 
223 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  49.32 
 
 
218 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  50.92 
 
 
218 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  47 
 
 
218 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  45.37 
 
 
218 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  47.47 
 
 
219 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  47 
 
 
219 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  47 
 
 
219 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  41.59 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  43.65 
 
 
168 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  42.86 
 
 
200 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  39.13 
 
 
179 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  39.13 
 
 
196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  35.76 
 
 
206 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  39.88 
 
 
318 aa  108  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  38.89 
 
 
212 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  37.08 
 
 
198 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  37.43 
 
 
212 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  35.88 
 
 
200 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  36.53 
 
 
238 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  36.94 
 
 
188 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  37.06 
 
 
205 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  36.14 
 
 
205 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  38.37 
 
 
207 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  38.76 
 
 
206 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  36.72 
 
 
206 aa  99.4  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  36.14 
 
 
219 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  39.11 
 
 
207 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  39.11 
 
 
207 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  36.7 
 
 
243 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  36.97 
 
 
219 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  39.11 
 
 
207 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  37.99 
 
 
207 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  39.11 
 
 
207 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  39.29 
 
 
229 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  39.11 
 
 
207 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  39.11 
 
 
207 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  37.29 
 
 
207 aa  97.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  39.11 
 
 
207 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  39.29 
 
 
229 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  34.73 
 
 
246 aa  96.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  37.13 
 
 
200 aa  96.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  39.29 
 
 
236 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  37.99 
 
 
207 aa  96.7  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  38.15 
 
 
206 aa  96.3  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  39.29 
 
 
254 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  39.29 
 
 
254 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  34.07 
 
 
237 aa  96.3  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  36.9 
 
 
221 aa  96.3  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  35.64 
 
 
239 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  32.35 
 
 
209 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  37.99 
 
 
207 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  34.27 
 
 
200 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  35.11 
 
 
243 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  38.15 
 
 
219 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  37.5 
 
 
249 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  37.5 
 
 
249 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  38.15 
 
 
217 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  38.24 
 
 
216 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  38.32 
 
 
216 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  38.24 
 
 
217 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  37.84 
 
 
260 aa  93.2  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  37.5 
 
 
253 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  37.5 
 
 
253 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  37.5 
 
 
253 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  37.5 
 
 
234 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  34.68 
 
 
206 aa  93.2  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  37.5 
 
 
249 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  38.1 
 
 
236 aa  92.8  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  35.59 
 
 
206 aa  92.4  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  38.1 
 
 
236 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  38.82 
 
 
255 aa  92.4  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  33.71 
 
 
200 aa  92  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  37.84 
 
 
234 aa  92.4  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  35.18 
 
 
202 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  31.98 
 
 
206 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  34.44 
 
 
271 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  36.72 
 
 
209 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  32.78 
 
 
205 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  33.72 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  35.19 
 
 
193 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  33.72 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  36.45 
 
 
240 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  34.27 
 
 
205 aa  90.5  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  33.15 
 
 
205 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  36.69 
 
 
257 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  38.51 
 
 
191 aa  89.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  36.47 
 
 
204 aa  89.4  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  36.09 
 
 
237 aa  89  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  40.61 
 
 
267 aa  89  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  33.33 
 
 
226 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  35.5 
 
 
240 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  36.26 
 
 
224 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  35.06 
 
 
217 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  32.37 
 
 
213 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  32.37 
 
 
213 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  36.9 
 
 
225 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>