More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0628 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  100 
 
 		 102 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  46.39 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  55.22 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  49.45 
 
 		 202 aa  86.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  54.29 
 
 		 221 aa  86.3  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  45.16 
 
 		 209 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  46.73 
 
 		 206 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 206 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  54.55 
 
 		 205 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  53.25 
 
 		 205 aa  83.6  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  54.29 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  41.18 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  50.68 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  43.52 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  39.05 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  43.52 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  43.52 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  43.52 
 
 		 207 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  43.52 
 
 		 207 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  43.52 
 
 		 207 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  43.52 
 
 		 207 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  54.17 
 
 		 205 aa  80.5  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  40.62 
 
 		 318 aa  80.1  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  41.28 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  45.79 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  44.9 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  41.24 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  49.3 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  50.72 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  40 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  42.27 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  42.99 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  38.24 
 
 		 222 aa  77.8  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  46.58 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  48.57 
 
 		 225 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  43.82 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  50 
 
 		 223 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 222 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  52.78 
 
 		 217 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  48.61 
 
 		 201 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  40.38 
 
 		 206 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  51.43 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  50 
 
 		 196 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  50 
 
 		 201 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  41.74 
 
 		 265 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  43.43 
 
 		 223 aa  77  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  40.57 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  42.59 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  47.95 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  46.58 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  48.65 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  46.75 
 
 		 545 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  46.75 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  46.75 
 
 		 265 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  46.38 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  46.75 
 
 		 265 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  51.39 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  46.75 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  46.75 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  46.75 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  52.31 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  47.44 
 
 		 217 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  42.39 
 
 		 200 aa  73.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  42.53 
 
 		 218 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  45.21 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  39.22 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  45.21 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  49.28 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  45.21 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  43.02 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  39.45 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  41.3 
 
 		 200 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  47.56 
 
 		 237 aa  72  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  46.27 
 
 		 205 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  41.86 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  41.33 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  48.61 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  41.77 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  49.28 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  44.87 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  44.87 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  46.15 
 
 		 217 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  39.42 
 
 		 213 aa  70.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  44.87 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  44.87 
 
 		 217 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  42.47 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  42.47 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  42.47 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  44.29 
 
 		 207 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  42.67 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  37 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  38.68 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  44.29 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  45.71 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  45.45 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  47.22 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>