More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1922 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  58.1 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  57.14 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  54.81 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  63.01 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  51.96 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  51.43 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  51.43 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  51.43 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  50.48 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3651  cytochrome c, class I  54.81 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  45.45 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  54.79 
 
 		 104 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  45.71 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  51.92 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  54.32 
 
 		 98 aa  85.9  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  41.49 
 
 		 318 aa  84  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  45.71 
 
 		 200 aa  83.6  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  43.12 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  45.1 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  47.47 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  51.76 
 
 		 205 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  43.12 
 
 		 206 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0391  cytochrome c, class I  50 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.401855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  37.76 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  50.6 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  42.06 
 
 		 206 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  50.59 
 
 		 205 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  43.12 
 
 		 207 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  43.12 
 
 		 207 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  43.12 
 
 		 207 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  40.57 
 
 		 206 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  46.3 
 
 		 223 aa  77  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  44.04 
 
 		 207 aa  77  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  41.44 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  40.2 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  41.35 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  44.74 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  40.19 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  39.6 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  42.2 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  39.62 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  43.18 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  42.2 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  42.2 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  42.2 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  41.84 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  37.38 
 
 		 205 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  37.38 
 
 		 205 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  40.45 
 
 		 205 aa  73.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  38.83 
 
 		 193 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  41.44 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  38.32 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  37.38 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  39.22 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  38.68 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  40.74 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  36.45 
 
 		 205 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  37.84 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  41.35 
 
 		 198 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  41.05 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  48.65 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  39.25 
 
 		 207 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  38.53 
 
 		 221 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  43.9 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  42.68 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  39.36 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  36.08 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2331  cytochrome c, class I  45.35 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2354  cytochrome c class I  45.35 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  37.27 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  47.5 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1719  cytochrome c, class I  45.35 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  41.98 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  41.25 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  34.51 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  39.53 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  41.98 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  41.12 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  43.37 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  41.46 
 
 		 198 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  39.05 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2370  cytochrome c, class I  44.19 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16283  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  44.44 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2250  cytochrome c class I  44.19 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  36.63 
 
 		 202 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0546  cytochrome c, class I  42.05 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2249  cytochrome c class I  43.48 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802822 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0946  cytochrome c class I  43.02 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5673  cytochrome c, class I  44.19 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  40.74 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04432  cytochrome C4  36.26 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  51.25 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1859  cytochrome c family protein  41.98 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  37.76 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>