279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1859 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1859  cytochrome c family protein  100 
 
 		 324 aa  676    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  28.44 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  29.33 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  27.48 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  28.83 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  27.73 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  27.73 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  27.73 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  30.32 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  28.51 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  30.32 
 
 		 208 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35390  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  27.39 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  0.0513213 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  28.34 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  27.73 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  26.91 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  26.61 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  26.61 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  26.67 
 
 		 199 aa  67  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  28.96 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  41.98 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  27.88 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  26.43 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  26.43 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  26.43 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  27.93 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  39.24 
 
 		 105 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  39.24 
 
 		 105 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  39.24 
 
 		 105 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  26.18 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2984  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  26.56 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  35.24 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  22.75 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  26.18 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  25.44 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  27.43 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  33.02 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  33.02 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  35.92 
 
 		 107 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  33.02 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  40.45 
 
 		 104 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  25.21 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  28.95 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  24.77 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  24.77 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  31.13 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  24.58 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  41.38 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  41.38 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  41.38 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  31.13 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  23.95 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  31.13 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  31.13 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  31.13 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  26.32 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  23.21 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  26.67 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0546  cytochrome c, class I  25.1 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  24.77 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  29.86 
 
 		 208 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  23.38 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  25.11 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  24.32 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  24.88 
 
 		 168 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  25.99 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  25.99 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  25.99 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  25.99 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  36.84 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 98 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  25.99 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  25.99 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  26.96 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  25.99 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  26.92 
 
 		 262 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  37.63 
 
 		 104 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  24.9 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  26.47 
 
 		 223 aa  57  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  39.08 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  26.46 
 
 		 261 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  33.7 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  26.75 
 
 		 235 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  39.78 
 
 		 198 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1399  cytochrome c553-like  35.63 
 
 		 203 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  21.78 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  36.47 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  38.71 
 
 		 198 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  33.65 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  35.87 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  25.34 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  39.08 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  33.7 
 
 		 243 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  40.51 
 
 		 98 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  34.04 
 
 		 200 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 229 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  34.07 
 
 		 202 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  24.35 
 
 		 206 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  23.32 
 
 		 230 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>