More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03219 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  204  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  90.38 
 
 		 104 aa  186  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  73.08 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  57.14 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  62.5 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  49.04 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  49.04 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  49.04 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  53.85 
 
 		 98 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3651  cytochrome c, class I  63.64 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  47.12 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  50.49 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  43.88 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  56.79 
 
 		 98 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0391  cytochrome c, class I  54.81 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.401855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  58.57 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  45.05 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  47 
 
 		 223 aa  85.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  44.66 
 
 		 318 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  50 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  40.57 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  48.86 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  46.25 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  47.5 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  48.86 
 
 		 205 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  41.51 
 
 		 206 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  45.71 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  44.34 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  41.51 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  40.57 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  43.52 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  43.52 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  39.81 
 
 		 221 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  43.88 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  42.42 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  40.37 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  46.43 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  36.11 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  36.79 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  44.58 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  36.79 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  36.79 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  36.79 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  45.35 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  47.67 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  35.85 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  35.85 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  35.85 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  39.8 
 
 		 200 aa  73.9  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  38.68 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 207 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  46.48 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  42.72 
 
 		 211 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  39.09 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  39.09 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  50 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  46.75 
 
 		 200 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  45.28 
 
 		 203 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  48.75 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  44.87 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  45.45 
 
 		 200 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  41.11 
 
 		 287 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04432  cytochrome C4  41.46 
 
 		 252 aa  70.5  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  36 
 
 		 193 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3403  cytochrome c class I  41.46 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.670594  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  43.02 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  43.9 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  36.27 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  39.76 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  44.59 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  44.94 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  39.82 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  41.96 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  40.52 
 
 		 219 aa  67.4  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  39.18 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  44.05 
 
 		 206 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  40.86 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  36.27 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  40.19 
 
 		 220 aa  67  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  47.83 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  43.4 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  43.42 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  42.11 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  41.86 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  40 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1173  cytochrome c class I  40.51 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000726448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  42.11 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  40.82 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  44.93 
 
 		 256 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  41.75 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  42.25 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  37.97 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  39.81 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  41.3 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>