More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0149 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  100 
 
 		 287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  44.06 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  60.76 
 
 		 103 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  52.44 
 
 		 107 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  39.26 
 
 		 137 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  53.16 
 
 		 102 aa  87  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  54.67 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0083  putative cytochrome c  33.81 
 
 		 184 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  37.72 
 
 		 135 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  35.14 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  41.07 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  33.54 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  33.54 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  33.54 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  41.07 
 
 		 148 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  34.23 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  32.7 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  31.87 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  34.23 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  40.52 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  41.58 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  39.05 
 
 		 136 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 147 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  47.25 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  32.88 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0264  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 112 aa  73.9  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  43.48 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  49.3 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  32.82 
 
 		 137 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  41.25 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  45.12 
 
 		 108 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  42.67 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  41.11 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  38 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  48.81 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  34.78 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  32.52 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  31.54 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  35.96 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  32.52 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  36.28 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  36.3 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  47.89 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0153  cytochrome c-555, membrane-bound  45.21 
 
 		 131 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170393  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1443  cytochrome c-555, membrane-bound  34.69 
 
 		 116 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0029  cytochrome c class I  43.59 
 
 		 163 aa  68.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00298904  hitchhiker  0.00000795968 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2463  cytochrome c, class I  46.67 
 
 		 140 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.480155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  42.35 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0214  cytochrome c class I  44.87 
 
 		 144 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2352  cytochrome c class I  44.05 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  38.89 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  34.51 
 
 		 225 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  45.95 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  32.56 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  44.59 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  42.31 
 
 		 159 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  33.33 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  42.31 
 
 		 159 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  44.94 
 
 		 113 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0208  cytochrome c, class I  32.28 
 
 		 180 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  37.8 
 
 		 104 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  33.63 
 
 		 135 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  39.74 
 
 		 161 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 112 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0103  cytochrome c-555, membrane-bound  43.42 
 
 		 140 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0151549  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  43.75 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  36.08 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  31.97 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  41.3 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  38.46 
 
 		 107 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  39.74 
 
 		 128 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  43.02 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  43.06 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2262  cytochrome c family protein  38.1 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2122  cytochrome c family protein  38.1 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0152  cytochrome c-555  37.23 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110389  normal  0.576701 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  41.25 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2067  cytochrome c family protein  38.46 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272994  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  38.37 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0988  cytochrome c family protein  38.1 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  31.94 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  38.27 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  38.27 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  38.3 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  31.94 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.388168 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  38.27 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  39.24 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2318  cytochrome c family protein  38.16 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>