153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_70340 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  100 
 
 		 129 aa  261  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6104  putative cytochrome c(mono-heme type)  81.4 
 
 		 127 aa  170  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415894  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2493  cytochrome c(mono-heme type)  59.29 
 
 		 120 aa  140  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0117122  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0095  cytochrome c family protein  46.15 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1715  hypothetical protein  44.04 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128981  normal  0.195089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  44.68 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  52.17 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1741  cytochrome c  45.83 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  51.43 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2981  cytochrome c-type protein  37.74 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  51.39 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  50.68 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0125  cytochrome c-type protein  45.35 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0350268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2849  cytochrome c family protein  36.19 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000128252  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  47.22 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  45.88 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0142  cytochrome c5-like protein  45.35 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  47.83 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5103  cytochrome c-type protein  48.65 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0054  cytochrome c-type protein  49.32 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  45.88 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0140  cytochrome c-type protein  40.37 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  50 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  45.88 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  45.88 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  45.88 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  45.88 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  45.88 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  0.0000000000331566 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  45.88 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  49.3 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3332  cytochrome c-type protein  45.71 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  47.14 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0156  cytochrome c5-like protein  48.57 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  48.57 
 
 		 97 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0246  cytochrome c  48.57 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00117918  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  42.35 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0191  cytochrome c, class I  48.57 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000235852  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  44.87 
 
 		 97 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  45.83 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0180  cytochrome c, class I  44.29 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6290  putative cytochrome  46.38 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  44.29 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72470  putative cytochrome  46.38 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  45.95 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  45.95 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  42.86 
 
 		 230 aa  72  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  43.84 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  43.42 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  42.86 
 
 		 382 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0213  hypothetical protein  41.94 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000412444  hitchhiker  0.00201322 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  45.07 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  44.93 
 
 		 225 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0233  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0215738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2318  cytochrome c family protein  39.51 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  43.48 
 
 		 266 aa  67.4  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4918  putative cytochrome c family protein  37.35 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.840892  hitchhiker  0.00914524 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0153  cytochrome c-555, membrane-bound  39.24 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170393  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2067  cytochrome c family protein  38.27 
 
 		 164 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272994  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0988  cytochrome c family protein  38.27 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2262  cytochrome c family protein  38.27 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  39.44 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2122  cytochrome c family protein  38.27 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  34.31 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  41.43 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  40.58 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  54.72 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  43.06 
 
 		 299 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  56.6 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  38.55 
 
 		 537 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  38.55 
 
 		 537 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2304  cytochrome c class I  41.1 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000896467  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  36.08 
 
 		 287 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  52.83 
 
 		 297 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  44.59 
 
 		 350 aa  63.5  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  35.11 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0917  cytochrome c-555  53.85 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  37.84 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  50.94 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  41.43 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  38.36 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2464  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182087  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  38.36 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0239  cytochrome c5  40.45 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  40.85 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0214  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  52.83 
 
 		 298 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2463  cytochrome c, class I  40.48 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.480155  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1443  cytochrome c-555, membrane-bound  39.44 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02091  lipoprotein  39.47 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  52.83 
 
 		 300 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0249  cytochrome c5-like protein  41.67 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  47.17 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  49.06 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  36.28 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  49.06 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2353  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  50.94 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4058  cytochrome c class I  38.16 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5177  cytochrome c5  38.36 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129919  normal  0.155967 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>