156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001977 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  100 
 
 		 137 aa  284  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  88.55 
 
 		 131 aa  246  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  75.91 
 
 		 135 aa  223  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  63.04 
 
 		 135 aa  173  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  56.69 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  50 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  48.92 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  56.76 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  48.25 
 
 		 223 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  56.58 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  45.11 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  46.02 
 
 		 216 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  46.49 
 
 		 225 aa  99  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  35.62 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  35.62 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  57.69 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  57.69 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  47.96 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  43.86 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  43.86 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02091  lipoprotein  57.14 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47940  cytochrome c5 protein  41.18 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  53.25 
 
 		 161 aa  87.4  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4918  putative cytochrome c family protein  53.95 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.840892  hitchhiker  0.00914524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  41.27 
 
 		 297 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  32.77 
 
 		 192 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4170  cytochrome c class I  55.84 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4058  cytochrome c class I  55.84 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  40.91 
 
 		 295 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 295 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 295 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2262  cytochrome c family protein  51.95 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2318  cytochrome c family protein  51.95 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  39.06 
 
 		 302 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  39.06 
 
 		 302 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2067  cytochrome c family protein  51.95 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2122  cytochrome c family protein  51.95 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3332  cytochrome c-type protein  48.65 
 
 		 96 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0988  cytochrome c family protein  50.65 
 
 		 164 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  50 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  51.25 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  37.98 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  36.8 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0362  cytochrome c5-like protein  53.95 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000104978  hitchhiker  0.00044408 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  42.06 
 
 		 266 aa  81.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  47.3 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 273 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  49.3 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0249  cytochrome c5-like protein  38.97 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0054  cytochrome c-type protein  47.37 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  42.98 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  43 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  45.95 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  37.88 
 
 		 298 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  37.88 
 
 		 297 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  47.3 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0203  cytochrome c5  36.17 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768078  hitchhiker  0.00155687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  44.59 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  44.59 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  44.59 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  0.0000000000331566 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0971  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  48.65 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0941  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  38.76 
 
 		 300 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0140  cytochrome c-type protein  44.59 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  45.33 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  48.65 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  47.3 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  43.24 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  40.15 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  35.4 
 
 		 537 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  35.4 
 
 		 537 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5319  cytochrome c5  34.72 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5522  cytochrome c5  37.12 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  53.95 
 
 		 319 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0125  cytochrome c-type protein  43.24 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0350268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5103  cytochrome c-type protein  44.59 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0142  cytochrome c5-like protein  43.24 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5177  cytochrome c5  34.75 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129919  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  38.53 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  41.89 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3542  putative cytochrome  41.27 
 
 		 181 aa  73.6  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  41.89 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  41.89 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 297 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  43.56 
 
 		 180 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.388168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  43.56 
 
 		 179 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  42.67 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2493  cytochrome c(mono-heme type)  42.25 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0117122  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2353  cytochrome c class I  41.25 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0200  cytochrome c class I  32.5 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.657824  normal  0.710005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03815  cytochrome C5  31.29 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0213  hypothetical protein  45.21 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000412444  hitchhiker  0.00201322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6290  putative cytochrome  44 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72470  putative cytochrome  44 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  32.82 
 
 		 287 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5267  cytochrome c5  39.09 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6104  putative cytochrome c(mono-heme type)  47.89 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415894  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0246  cytochrome c  43.24 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00117918  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4983  cytochrome c, class I  43.14 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>