163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0205 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  36.16 
 
 		 302 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  35.59 
 
 		 302 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  37.7 
 
 		 179 aa  114  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  37.7 
 
 		 180 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.388168 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  34.46 
 
 		 296 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  33.9 
 
 		 295 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  33.9 
 
 		 295 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  33.9 
 
 		 295 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  39.33 
 
 		 167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 297 aa  111  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 137 aa  111  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  35.39 
 
 		 298 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  35.39 
 
 		 300 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0208  cytochrome c, class I  35.56 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  36.96 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1307  cytochrome c class I  36.65 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  45.74 
 
 		 134 aa  107  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  34.27 
 
 		 319 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  32.61 
 
 		 298 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  32.61 
 
 		 297 aa  104  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  33.7 
 
 		 294 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  37.85 
 
 		 299 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  37.85 
 
 		 299 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  37.85 
 
 		 299 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  36.41 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  37.85 
 
 		 299 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4983  cytochrome c, class I  34.59 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  37.85 
 
 		 299 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  37.85 
 
 		 299 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  38.42 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  38.59 
 
 		 294 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  43.09 
 
 		 223 aa  98.6  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  60.81 
 
 		 147 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3542  putative cytochrome  36.67 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  52.27 
 
 		 225 aa  95.5  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  36.16 
 
 		 288 aa  95.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  55.95 
 
 		 275 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  56.25 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  50.63 
 
 		 230 aa  93.2  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  35.33 
 
 		 273 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  53.25 
 
 		 266 aa  92  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4918  putative cytochrome c family protein  55 
 
 		 137 aa  90.9  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.840892  hitchhiker  0.00914524 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  55.7 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  55.7 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  59.46 
 
 		 293 aa  89.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  52.86 
 
 		 103 aa  89  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 299 aa  88.6  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  37.3 
 
 		 216 aa  87.8  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  35.66 
 
 		 145 aa  86.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  51.25 
 
 		 128 aa  85.9  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 136 aa  85.9  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  52.05 
 
 		 148 aa  85.1  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  37.01 
 
 		 137 aa  85.1  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02091  lipoprotein  53.75 
 
 		 135 aa  84.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  37.01 
 
 		 135 aa  84.7  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2318  cytochrome c family protein  48.19 
 
 		 164 aa  84.3  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  52.44 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4170  cytochrome c class I  53.75 
 
 		 140 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2262  cytochrome c family protein  49.37 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4058  cytochrome c class I  53.75 
 
 		 140 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0917  cytochrome c-555  52.5 
 
 		 111 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  32.58 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2067  cytochrome c family protein  46.51 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2122  cytochrome c family protein  49.37 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2117  cytochrome c class I  46.02 
 
 		 141 aa  84  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000139618  normal  0.419433 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0988  cytochrome c family protein  48.1 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  45.74 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0498  cytochrome c class I  35.75 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0029  cytochrome c class I  33.52 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00298904  hitchhiker  0.00000795968 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  50.65 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  39.06 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  39.06 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  48.65 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2304  cytochrome c class I  51.25 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000896467  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0213  cytochrome c class I  48.75 
 
 		 111 aa  80.9  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0203  cytochrome c5  36.84 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768078  hitchhiker  0.00155687 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  43.18 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  37.1 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  36.73 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5319  cytochrome c5  37.59 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241325 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2352  cytochrome c class I  50 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  45.33 
 
 		 99 aa  77  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  45.33 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3332  cytochrome c-type protein  42.11 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  44.44 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47940  cytochrome c5 protein  39.22 
 
 		 134 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5267  cytochrome c5  36.09 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5177  cytochrome c5  36.09 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129919  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  46.67 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2493  cytochrome c(mono-heme type)  41.67 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0117122  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  36.94 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2463  cytochrome c, class I  48.75 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.480155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  45.33 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0249  cytochrome c5-like protein  32.69 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  42.67 
 
 		 99 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  44 
 
 		 97 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  42.67 
 
 		 99 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>