More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00327 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  100 
 
 		 153 aa  305  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  75.16 
 
 		 153 aa  211  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  47.87 
 
 		 115 aa  90.1  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  53.95 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0908  cytochrome c, class I  50 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.413276  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  53.52 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  48.65 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  50 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  38.61 
 
 		 221 aa  77.4  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  48.24 
 
 		 205 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00326  cytochrome C4  44.44 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0934  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  43.04 
 
 		 318 aa  75.5  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1635  putative cytochrome  48 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.240566  normal  0.477632 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  53.85 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  43.75 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  43.02 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  45.16 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  43.02 
 
 		 198 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  45.95 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  43.02 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  42 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  42.35 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  41.76 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  51.39 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  47.3 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  47.5 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  48.75 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  41.33 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  41.76 
 
 		 207 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  41.05 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  47.5 
 
 		 223 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  45.88 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  47.95 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  44.74 
 
 		 221 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  39.64 
 
 		 206 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  47.5 
 
 		 205 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  44.74 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  44.74 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  44.74 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1024  cytochrome c, class I  46.48 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462828  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  41.76 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  40 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  44.05 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  50.77 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  41.76 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  41.76 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  41.76 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  47.5 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  41.76 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  41.76 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  44.94 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  46.15 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  41.76 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  46.15 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  39.45 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1233  cytochrome c class I  41.77 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911336  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  42.22 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0966  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  34.35 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  44.19 
 
 		 206 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  45.98 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5673  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  46.58 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  39.51 
 
 		 227 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  43.62 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1017  cytochrome c, class IC  46.15 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1179  cytochrome c family protein  46.15 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1332  cytochrome c, class IC  46.15 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0014287  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0848  cytochrome C4 family protein  46.15 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412823  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  46.48 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0300  cytochrome c, class IC  46.15 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949004  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1171  cytochrome c family protein  46.15 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  38.82 
 
 		 211 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  49.3 
 
 		 201 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  40.48 
 
 		 206 aa  67  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  39.78 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  43.48 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  41.25 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0967  cytochrome c family protein  39.81 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3313  putative cytochrome C precursor-related protein  39.74 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477709  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1172  cytochrome c family protein  39.81 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  44.16 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  42.11 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2370  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16283  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  41.86 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  45.83 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2331  cytochrome c, class I  40 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  46.48 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  38.55 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0946  cytochrome c class I  40 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  41.86 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  46.48 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  40.91 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2354  cytochrome c class I  40 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2250  cytochrome c class I  40.91 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  49.25 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1719  cytochrome c, class I  40 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  43.14 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>