165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA3003 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  100 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  100 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  100 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  100 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  100 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  99.33 
 
 		 299 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  99.64 
 
 		 275 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  89.67 
 
 		 300 aa  474  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  77.26 
 
 		 297 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  76.16 
 
 		 302 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  75.83 
 
 		 302 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  73.91 
 
 		 295 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  70.57 
 
 		 298 aa  387  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  73.91 
 
 		 295 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  73.91 
 
 		 295 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  73.24 
 
 		 296 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  65.22 
 
 		 319 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  68 
 
 		 300 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  55.67 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  54.98 
 
 		 298 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  54.3 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  58.03 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  58.84 
 
 		 294 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  52.38 
 
 		 293 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  48.85 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  51.85 
 
 		 288 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  56.6 
 
 		 167 aa  175  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3542  putative cytochrome  57.14 
 
 		 181 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0029  cytochrome c class I  52.12 
 
 		 163 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00298904  hitchhiker  0.00000795968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4983  cytochrome c, class I  50.6 
 
 		 183 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  49.69 
 
 		 180 aa  152  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.388168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  49.69 
 
 		 179 aa  152  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0208  cytochrome c, class I  49.36 
 
 		 180 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1307  cytochrome c class I  51.9 
 
 		 174 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0498  cytochrome c class I  50.31 
 
 		 180 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  49.13 
 
 		 202 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  37.85 
 
 		 185 aa  119  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  53.7 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  48.76 
 
 		 148 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  30.77 
 
 		 206 aa  95.9  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  49.43 
 
 		 216 aa  92.4  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  25 
 
 		 537 aa  89.7  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  25 
 
 		 537 aa  89.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0362  cytochrome c5-like protein  40.74 
 
 		 195 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000104978  hitchhiker  0.00044408 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 137 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  44.34 
 
 		 136 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  50 
 
 		 223 aa  87  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  49.33 
 
 		 225 aa  86.7  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  39.71 
 
 		 147 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 145 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4058  cytochrome c class I  53.95 
 
 		 140 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4170  cytochrome c class I  53.95 
 
 		 140 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02091  lipoprotein  55.26 
 
 		 135 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0840  putative cytochrome c5  48.84 
 
 		 157 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.674138  normal  0.844917 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0233  cytochrome c, class I  49.37 
 
 		 171 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0215738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  48.05 
 
 		 112 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  29.84 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  46.34 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0213  hypothetical protein  48.05 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000412444  hitchhiker  0.00201322 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4918  putative cytochrome c family protein  51.19 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.840892  hitchhiker  0.00914524 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  51.25 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  51.25 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  48.72 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  49.38 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  45.45 
 
 		 97 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  52.11 
 
 		 135 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  49.38 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  40 
 
 		 135 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2304  cytochrome c class I  44.83 
 
 		 107 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000896467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  53.33 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  45.57 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  41.41 
 
 		 135 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2318  cytochrome c family protein  48.72 
 
 		 164 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0917  cytochrome c-555  46.91 
 
 		 111 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2117  cytochrome c class I  39.32 
 
 		 141 aa  73.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000139618  normal  0.419433 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  38.93 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2262  cytochrome c family protein  48.05 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2122  cytochrome c family protein  48.05 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  36.21 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  36.21 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2067  cytochrome c family protein  48.05 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  43.75 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0988  cytochrome c family protein  48.05 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2353  cytochrome c class I  41.84 
 
 		 101 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0083  putative cytochrome c  37.5 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  38.06 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  43.37 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  39.8 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2464  cytochrome c, class I  43.53 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182087  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  38.04 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  30.56 
 
 		 142 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0213  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 111 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  41.25 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  38.24 
 
 		 99 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0203  cytochrome c5  32.17 
 
 		 140 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768078  hitchhiker  0.00155687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5177  cytochrome c5  32.87 
 
 		 140 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129919  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47940  cytochrome c5 protein  33.57 
 
 		 134 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5319  cytochrome c5  32.87 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5522  cytochrome c5  32.62 
 
 		 138 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224479 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>