More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1071 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  100 
 
 		 105 aa  216  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  58.02 
 
 		 205 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  46.6 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  47.06 
 
 		 205 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  45.19 
 
 		 221 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  47.06 
 
 		 207 aa  87.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  42.42 
 
 		 318 aa  87  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  49.35 
 
 		 206 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  50.7 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  46.59 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  38 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  42.57 
 
 		 209 aa  80.1  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  43.3 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  41.05 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  40.7 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  41.58 
 
 		 196 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  45.35 
 
 		 179 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  43.9 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  41.24 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  37.25 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  35.64 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  46.58 
 
 		 200 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  48.53 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  47.37 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  46.58 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  38.55 
 
 		 222 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  42.22 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  38.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  40.48 
 
 		 214 aa  70.9  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  39.42 
 
 		 207 aa  70.5  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  42.53 
 
 		 211 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  35.58 
 
 		 205 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  46.15 
 
 		 287 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  33.94 
 
 		 207 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  33.94 
 
 		 207 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  41.49 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  41.46 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  33.94 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  39.05 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  38.14 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  33.94 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  33.94 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  33.94 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  33.94 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  34.86 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  37 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  34.55 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  35.35 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  38.83 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  35.24 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  39.24 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  37.11 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  34.55 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  33.03 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  34.26 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  41.86 
 
 		 242 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  37.86 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  36.67 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  43.06 
 
 		 262 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  43.06 
 
 		 262 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  43.06 
 
 		 262 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  45.07 
 
 		 266 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  40.96 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  38.39 
 
 		 217 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  43.62 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  42.03 
 
 		 196 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  42.03 
 
 		 201 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  40.18 
 
 		 217 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  36.27 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  41.03 
 
 		 222 aa  66.6  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  39.18 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  41.03 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0979  cytochrome c class I  42.5 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0035019  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  34.29 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  35 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  37.84 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  35 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  35 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  40.51 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1173  cytochrome c class I  41.03 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000726448 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  43.94 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  40 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  38.75 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  43.06 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  42.47 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  37.62 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  37.18 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  37.89 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  35.58 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  38.2 
 
 		 218 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  37.78 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  38.27 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  41.77 
 
 		 226 aa  64.3  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  34.29 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>