155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00078 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  100 
 
 
135 aa  275  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  64.44 
 
 
136 aa  174  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  50.75 
 
 
135 aa  124  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  51.43 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  39.01 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  45.59 
 
 
137 aa  114  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5522  cytochrome c5  49.62 
 
 
138 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  39.72 
 
 
142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0203  cytochrome c5  45.19 
 
 
140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768078  hitchhiker  0.00155687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5319  cytochrome c5  45.93 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47940  cytochrome c5 protein  50.77 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  42.96 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0249  cytochrome c5-like protein  45.86 
 
 
136 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  46.51 
 
 
131 aa  110  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5177  cytochrome c5  44.44 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129919  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  54.76 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  48.76 
 
 
142 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  48.76 
 
 
136 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  41.73 
 
 
145 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5267  cytochrome c5  48.21 
 
 
121 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  47.27 
 
 
134 aa  100  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  49.35 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  49.35 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  49.35 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  50.65 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  49.35 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  49.35 
 
 
99 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  49.35 
 
 
99 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  49.35 
 
 
99 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  49.35 
 
 
99 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  0.0000000000331566 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  46.02 
 
 
300 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  45.13 
 
 
298 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  45.54 
 
 
297 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0246  cytochrome c  47.73 
 
 
97 aa  87.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00117918  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  49.4 
 
 
97 aa  87  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  52.63 
 
 
97 aa  87  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0191  cytochrome c, class I  52.63 
 
 
97 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000235852  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  43.75 
 
 
302 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  43.75 
 
 
302 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  41.18 
 
 
296 aa  84.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  48.96 
 
 
300 aa  84.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0180  cytochrome c, class I  48.68 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245077  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  48.96 
 
 
299 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  48.96 
 
 
299 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  48.96 
 
 
299 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  48.96 
 
 
299 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  48.96 
 
 
299 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  48.96 
 
 
299 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  48.96 
 
 
275 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  46.43 
 
 
297 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  46.43 
 
 
298 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  37.72 
 
 
287 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0239  cytochrome c5  44.05 
 
 
107 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0106  cytochrome c5  45.24 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  42.86 
 
 
295 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  42.86 
 
 
295 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  42.86 
 
 
295 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  32.56 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  40.19 
 
 
225 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  40 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  44.86 
 
 
297 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  51.9 
 
 
319 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  43 
 
 
266 aa  80.5  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  44.64 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  39.25 
 
 
223 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  42.42 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  46.75 
 
 
206 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  46.05 
 
 
97 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  41.89 
 
 
537 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  42.2 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  41.89 
 
 
537 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  35.58 
 
 
273 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  36.61 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  38.84 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  43.18 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  43.59 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0083  putative cytochrome c  35.04 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4983  cytochrome c, class I  42.72 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3542  putative cytochrome  42.11 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  32.72 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  44.3 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  44.3 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02091  lipoprotein  50 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  47.22 
 
 
288 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  44.87 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2981  cytochrome c-type protein  43.04 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4918  putative cytochrome c family protein  46.75 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.840892  hitchhiker  0.00914524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  43.59 
 
 
293 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0208  cytochrome c, class I  36.11 
 
 
180 aa  70.5  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3332  cytochrome c-type protein  40.66 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0498  cytochrome c class I  48 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  51.43 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0029  cytochrome c class I  39.6 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00298904  hitchhiker  0.00000795968 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4170  cytochrome c class I  47.44 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72470  putative cytochrome  43.24 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.240625  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6290  putative cytochrome  43.24 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4058  cytochrome c class I  47.44 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435905  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2849  cytochrome c family protein  38.75 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000128252  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  43.04 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1307  cytochrome c class I  43.14 
 
 
174 aa  67  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466199 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>