More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3764 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  100 
 
 
104 aa  208  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  68.27 
 
 
105 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  68.27 
 
 
105 aa  149  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  68.27 
 
 
105 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  51.92 
 
 
104 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  52.94 
 
 
104 aa  103  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  54.84 
 
 
104 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  50 
 
 
108 aa  99.4  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  46.53 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  55.34 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  57.83 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  47.83 
 
 
105 aa  89.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  55.42 
 
 
98 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3651  cytochrome c, class I  59.79 
 
 
112 aa  87.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  52.81 
 
 
205 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  45.28 
 
 
206 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  48.51 
 
 
223 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  52.81 
 
 
113 aa  84.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  51.69 
 
 
205 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  42.31 
 
 
207 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  42.31 
 
 
207 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  42.31 
 
 
207 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  52.27 
 
 
200 aa  83.6  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  42.31 
 
 
207 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  41.9 
 
 
206 aa  83.6  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  50.6 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  42.31 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  53.16 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  42.31 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  42.31 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  40.57 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  44.12 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  47.06 
 
 
229 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  51.25 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  53.09 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  44.55 
 
 
205 aa  80.5  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  43.75 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  40.95 
 
 
206 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  46.07 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  48.68 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  39.42 
 
 
207 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  44.04 
 
 
207 aa  77.4  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04432  cytochrome C4  42.68 
 
 
252 aa  77  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  38.61 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  40 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  49.46 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  50 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  51.16 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  48.62 
 
 
238 aa  74.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  41.9 
 
 
207 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  39.42 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  46.94 
 
 
418 aa  72.8  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  41.24 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2100  cytochrome c class I  42.59 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  40.95 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  44.19 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  40.95 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  40.95 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  46.25 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  47.25 
 
 
221 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  42.16 
 
 
206 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  47.62 
 
 
225 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  44.34 
 
 
220 aa  70.9  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1024  cytochrome c, class I  46.51 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462828  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0930  cytochrome c class I  45.98 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  47.37 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  37.93 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3403  cytochrome c class I  37.8 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.670594  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  37.93 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  45.63 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  43.4 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  49.32 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0391  cytochrome c, class I  48.39 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.401855  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  45.78 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  40.82 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0865  cytochrome c class I  45.98 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394911  normal  0.438525 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  39.39 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  49.41 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0999  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  50 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.209116  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  40 
 
 
287 aa  68.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  42.11 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  46.99 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  44.58 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  43.9 
 
 
205 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  38.32 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  47.56 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  38.32 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  48.84 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  39.81 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  37.04 
 
 
221 aa  67.4  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  41.46 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0987  cytochrome c, class I  45.35 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  39.8 
 
 
200 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  43.14 
 
 
106 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  42 
 
 
219 aa  67  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0934  cytochrome c class I  44.64 
 
 
117 aa  67  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  41.28 
 
 
221 aa  67  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0966  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  45.88 
 
 
119 aa  67  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1179  cytochrome c family protein  46.34 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1017  cytochrome c, class IC  46.34 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>