More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0707 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  100 
 
 		 146 aa  302  9.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  71.6 
 
 		 105 aa  126  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  56 
 
 		 106 aa  116  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  60.23 
 
 		 108 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  43.88 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  43.88 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  45.1 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  45.1 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  45.1 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  50.62 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  44.23 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  46.53 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  43.16 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  39.22 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  40.95 
 
 		 206 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  40.2 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  40.74 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  40.4 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  39.05 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  39.8 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 206 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  42.57 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  37.38 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  46.15 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  36.89 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  35.64 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 207 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0391  cytochrome c, class I  42.55 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.401855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  44.19 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  36.04 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  34.26 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  34.58 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  36.26 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3403  cytochrome c class I  40.24 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.670594  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  42.7 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  33.96 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  39.53 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  40.51 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  43.82 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  33 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  31.78 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  37.5 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  35.82 
 
 		 208 aa  63.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0908  cytochrome c, class I  44.16 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.413276  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 211 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  33.68 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  36.08 
 
 		 207 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  36.08 
 
 		 207 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  36.08 
 
 		 207 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  36.08 
 
 		 207 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  36.08 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  36.08 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  36.08 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  36.08 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  38.1 
 
 		 206 aa  62  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  34.34 
 
 		 207 aa  62  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  36 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3651  cytochrome c, class I  43.33 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  37.5 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  38.27 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  40.48 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  41.03 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  38.61 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  34.44 
 
 		 318 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  31.73 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  38.64 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  37 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  34.45 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  33.71 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  33.64 
 
 		 220 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  35.16 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  37.86 
 
 		 203 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00326  cytochrome C4  38.2 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  33.78 
 
 		 224 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  35.42 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  35.42 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  38.71 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  32.17 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04432  cytochrome C4  34.15 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  36 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  41.33 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  38.71 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  38.71 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  33.75 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1024  cytochrome c, class I  34.55 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462828  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  34.58 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  39.78 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  31.9 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  30.09 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  38.57 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  31.07 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  38.83 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  33.33 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  38.24 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  38.37 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 287 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  36.78 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>