More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0878 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  100 
 
 		 105 aa  218  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  71.6 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  56.6 
 
 		 106 aa  124  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  65.52 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  48.35 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  47.96 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  46.32 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  46.32 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  46.32 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  45.05 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  37.76 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  41.82 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  49.3 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  45.35 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  42.17 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3403  cytochrome c class I  39.51 
 
 		 266 aa  70.5  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.670594  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  38.38 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0391  cytochrome c, class I  43.96 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.401855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  36.27 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  37.78 
 
 		 200 aa  67  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  38 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  43.66 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  39.51 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  32.94 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  37 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  37 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3651  cytochrome c, class I  38.18 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  36.89 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  39.33 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  32.04 
 
 		 206 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  34 
 
 		 206 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 206 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  37.21 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04432  cytochrome C4  33.33 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  31.87 
 
 		 224 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  35.71 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  35.92 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  39.24 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  32.53 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  35.56 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  40.26 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  37.8 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  36.17 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  33.67 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  33.7 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  35.37 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  32.73 
 
 		 229 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  32.84 
 
 		 208 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  41.18 
 
 		 209 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  38.81 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  32.65 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  33.33 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  37.21 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  34.83 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  35.44 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  37.68 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  34.44 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  36.14 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  31.31 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  34.83 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  35 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  28.87 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  36.46 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1072  cytochrome c553  37.23 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.538556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  35.71 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  34.88 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  35.96 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  32.1 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  34.67 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2081  putative cytochrome c  36.23 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2369  cytochrome c, class I  38.64 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  40.58 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  32.32 
 
 		 207 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  40.58 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  36.23 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0908  cytochrome c, class I  35.42 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.413276  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  37.89 
 
 		 203 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1172  cytochrome c family protein  38.64 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0967  cytochrome c family protein  38.64 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  33.73 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1018  cytochrome c553  39.74 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0847  cytochrome C4  39.74 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0301  cytochrome c family protein  39.74 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1333  cytochrome c family protein  39.74 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00326957  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2100  cytochrome c class I  34.34 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  32.99 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1173  cytochrome c class I  32.86 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000726448 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  31.82 
 
 		 207 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1180  cytochrome c family protein  39.74 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>