280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2369 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2369  cytochrome c, class I  100 
 
 		 119 aa  247  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2249  cytochrome c class I  98.32 
 
 		 119 aa  243  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802822 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  95.8 
 
 		 119 aa  222  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2353  cytochrome c class I  94.96 
 
 		 119 aa  221  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2330  cytochrome c, class I  94.96 
 
 		 119 aa  221  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1718  cytochrome c, class I  94.96 
 
 		 119 aa  221  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0947  cytochrome c class I  91.18 
 
 		 119 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0967  cytochrome c family protein  87.62 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1172  cytochrome c family protein  86.67 
 
 		 122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1180  cytochrome c family protein  85.71 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0301  cytochrome c family protein  85.71 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1333  cytochrome c family protein  85.71 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00326957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1018  cytochrome c553  85.71 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0847  cytochrome C4  85.71 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233095  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  68.75 
 
 		 127 aa  157  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3313  putative cytochrome C precursor-related protein  63.64 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477709  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1233  cytochrome c class I  62.81 
 
 		 127 aa  140  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911336  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0934  cytochrome c class I  50.42 
 
 		 117 aa  113  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1000  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  49.18 
 
 		 133 aa  110  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0866  putative periplasmic cytochrome type-C oxidoreductase signal peptide protein  46.51 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.525765  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0908  cytochrome c, class I  47.97 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.413276  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0931  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  49.07 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.678097  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0988  cytochrome c, class I  50 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1025  cytochrome c, class I  50.82 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  50.59 
 
 		 219 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  48.24 
 
 		 220 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  40.51 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  43.56 
 
 		 229 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  39.39 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  37.97 
 
 		 221 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  35.05 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  40.95 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  36.25 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  36.25 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  40.21 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  44.94 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  38.82 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  41.77 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  41.38 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  40.62 
 
 		 113 aa  67  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  36.59 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  40.35 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  41 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  39.6 
 
 		 207 aa  63.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  41.88 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  41.3 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  40.22 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  47.37 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  41.03 
 
 		 205 aa  62  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  40.23 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  40 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  40.23 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  40.23 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  42.31 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  35.85 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  37 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  34.31 
 
 		 223 aa  60.5  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 220 aa  60.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 206 aa  60.1  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  37.63 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  40.23 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  37.63 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  40 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  39.78 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  39.08 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  40.96 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  40.96 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  33.96 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  42.39 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  40.57 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  38.96 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  39.76 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  37.93 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  36.73 
 
 		 318 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  42.11 
 
 		 223 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  38.82 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  33.61 
 
 		 219 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  40.23 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  37.25 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  40.45 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  37.93 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  37.93 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  43.04 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  37.5 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  42.25 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  35.24 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  36.27 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  34.91 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  40.51 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  40.28 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  33.02 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  38.64 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  39.08 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  38 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  34.74 
 
 		 206 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>