282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0934 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0934  cytochrome c class I  100 
 
 		 117 aa  233  9e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0908  cytochrome c, class I  74.38 
 
 		 121 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.413276  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1233  cytochrome c class I  61.11 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911336  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3313  putative cytochrome C precursor-related protein  57.78 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477709  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  55.1 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1000  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  52.99 
 
 		 133 aa  120  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0947  cytochrome c class I  55.45 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1180  cytochrome c family protein  54.46 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1333  cytochrome c family protein  54.46 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00326957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1018  cytochrome c553  54.46 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0301  cytochrome c family protein  54.46 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0847  cytochrome C4  54.46 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233095  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1172  cytochrome c family protein  53.47 
 
 		 122 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0967  cytochrome c family protein  53.47 
 
 		 122 aa  114  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0866  putative periplasmic cytochrome type-C oxidoreductase signal peptide protein  54.05 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.525765  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2369  cytochrome c, class I  52.94 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166553  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1025  cytochrome c, class I  55.34 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2353  cytochrome c class I  52.94 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  51.96 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2330  cytochrome c, class I  52.94 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1718  cytochrome c, class I  52.94 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507301  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0931  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  54.29 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.678097  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2249  cytochrome c class I  51.96 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0988  cytochrome c, class I  52.43 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  53.33 
 
 		 225 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  52.87 
 
 		 221 aa  96.7  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  53.09 
 
 		 221 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  54.12 
 
 		 219 aa  94.4  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  51.19 
 
 		 224 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  50.6 
 
 		 220 aa  90.5  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  51.11 
 
 		 230 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  47.67 
 
 		 221 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  48.24 
 
 		 219 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  48.24 
 
 		 219 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  42.31 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  46.84 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  44.55 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  42.2 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  40.91 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  41.05 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  42.06 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  44.44 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  44.58 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  44.58 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  43.12 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  41.11 
 
 		 205 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  44.59 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  43.59 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  43.42 
 
 		 205 aa  60.5  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  39.42 
 
 		 318 aa  60.1  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  35.24 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  43.24 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  36.36 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  43.42 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  39.25 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  37.61 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  38.18 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  38.18 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  40.24 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  38.18 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  41.28 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  39.08 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  44.59 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  38.14 
 
 		 207 aa  57  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  35.4 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  35.19 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  39.08 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  34.26 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  34.26 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  36.26 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  34.26 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  33.96 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  34.26 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  36.19 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  35.78 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  42.11 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  32.41 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  37.84 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  41.1 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  37.84 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  39.51 
 
 		 269 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  36.94 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  36.71 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00326  cytochrome C4  38.16 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  36.25 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 221 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  40.45 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  30 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  35.78 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 207 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 207 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  40.24 
 
 		 225 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  40.96 
 
 		 217 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  33.98 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>