264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0967 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0967  cytochrome c family protein  100 
 
 
122 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1172  cytochrome c family protein  99.18 
 
 
122 aa  250  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1180  cytochrome c family protein  98.36 
 
 
122 aa  248  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1333  cytochrome c family protein  98.36 
 
 
122 aa  248  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00326957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0847  cytochrome C4  98.36 
 
 
122 aa  248  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233095  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1018  cytochrome c553  98.36 
 
 
122 aa  248  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0301  cytochrome c family protein  98.36 
 
 
122 aa  248  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0947  cytochrome c class I  90.1 
 
 
119 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745275  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  88.24 
 
 
119 aa  192  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2369  cytochrome c, class I  88.24 
 
 
119 aa  191  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166553  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2353  cytochrome c class I  86.27 
 
 
119 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1718  cytochrome c, class I  86.27 
 
 
119 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507301  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2330  cytochrome c, class I  86.27 
 
 
119 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2249  cytochrome c class I  87.25 
 
 
119 aa  191  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.802822 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  66.39 
 
 
127 aa  163  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3313  putative cytochrome C precursor-related protein  62.99 
 
 
127 aa  150  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477709  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1233  cytochrome c class I  62.99 
 
 
127 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911336  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1000  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  50.41 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344958  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0934  cytochrome c class I  53.47 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0866  putative periplasmic cytochrome type-C oxidoreductase signal peptide protein  48.46 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.525765  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0908  cytochrome c, class I  47.06 
 
 
121 aa  110  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.413276  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0931  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  52.34 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.678097  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0988  cytochrome c, class I  50.49 
 
 
132 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1025  cytochrome c, class I  49.51 
 
 
132 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  48.81 
 
 
219 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  47.62 
 
 
220 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  42.39 
 
 
221 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  40.96 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  40 
 
 
221 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  43.37 
 
 
230 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  39.29 
 
 
219 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  39.29 
 
 
219 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  37.86 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  40.7 
 
 
225 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  46.59 
 
 
229 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  41.67 
 
 
222 aa  70.5  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  40 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  43.82 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  37.86 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  41.38 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  43.33 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  42.22 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  42.34 
 
 
211 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  40.18 
 
 
217 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  40.23 
 
 
217 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  40.23 
 
 
217 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  36.11 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  40.23 
 
 
217 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  40.91 
 
 
205 aa  61.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  45.83 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  39.22 
 
 
206 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  41.38 
 
 
207 aa  60.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  46.05 
 
 
200 aa  60.5  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  40.23 
 
 
217 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  38.04 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  39.29 
 
 
221 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  39.08 
 
 
217 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  42.17 
 
 
219 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  42.35 
 
 
217 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  42.17 
 
 
219 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  39.74 
 
 
205 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  40.96 
 
 
219 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  35.96 
 
 
219 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  34.58 
 
 
223 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  44.05 
 
 
218 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  36.79 
 
 
206 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  41.67 
 
 
220 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  41.03 
 
 
205 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  39.76 
 
 
217 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  38.96 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  37.63 
 
 
269 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  40.7 
 
 
318 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  39.81 
 
 
265 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  37.93 
 
 
217 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  37.25 
 
 
220 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  36.26 
 
 
227 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  37.93 
 
 
217 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  39.47 
 
 
206 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  45.57 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  33.96 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  37.5 
 
 
223 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  38.54 
 
 
205 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  40.45 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  35.85 
 
 
222 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  37.23 
 
 
225 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  39.8 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  33.04 
 
 
219 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  35.85 
 
 
222 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  42.35 
 
 
108 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  40 
 
 
218 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  36.78 
 
 
215 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  36.78 
 
 
206 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  36.78 
 
 
206 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  34.44 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  36.78 
 
 
206 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  36.78 
 
 
265 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  35.45 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  34.78 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  36.78 
 
 
265 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  37.66 
 
 
208 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>