More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1634 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  75.16 
 
 		 153 aa  214  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0908  cytochrome c, class I  47.56 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.413276  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  53.42 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0934  cytochrome c class I  42.31 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  51.43 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  42.73 
 
 		 209 aa  77  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  53.85 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  47.5 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  57.38 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  39.76 
 
 		 227 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  47.22 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  47.95 
 
 		 200 aa  70.5  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  46.91 
 
 		 205 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  42.67 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  35.25 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  50 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  35.25 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  46.91 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  32.31 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  46.05 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  42.05 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  47.95 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2369  cytochrome c, class I  40.96 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166553  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  47.76 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  45.68 
 
 		 223 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  40 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0947  cytochrome c class I  39.77 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  41.46 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  51.43 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2330  cytochrome c, class I  39.76 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  47.83 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2353  cytochrome c class I  39.76 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1718  cytochrome c, class I  39.76 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507301  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2249  cytochrome c class I  39.76 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  42.17 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  44.3 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  43.56 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0621  cytochrome c class I  37.72 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1172  cytochrome c family protein  40.96 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1180  cytochrome c family protein  40.96 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  48.53 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  36.08 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1333  cytochrome c family protein  40.96 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00326957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0847  cytochrome C4  40.96 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  42.05 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1018  cytochrome c553  40.96 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  38.64 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0967  cytochrome c family protein  40.96 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  40.22 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1233  cytochrome c class I  41.46 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911336  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0301  cytochrome c family protein  40.96 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  41.86 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  47.83 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  33.87 
 
 		 224 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1024  cytochrome c, class I  49.25 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462828  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  40.86 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  41.57 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  40.62 
 
 		 262 aa  64.7  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 266 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  36.04 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  43.84 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00326  cytochrome C4  44.93 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  39.18 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  50 
 
 		 273 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  46.88 
 
 		 198 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 207 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 207 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  42.86 
 
 		 217 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  42.25 
 
 		 219 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  48.75 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  53.42 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  42.03 
 
 		 222 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  36.63 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  37.63 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  35.14 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04432  cytochrome C4  41.57 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3313  putative cytochrome C precursor-related protein  38.75 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477709  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  41.18 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  45.24 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  45.88 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  44.16 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0866  putative periplasmic cytochrome type-C oxidoreductase signal peptide protein  37.78 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.525765  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0931  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  37.78 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.678097  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1000  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  38.2 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  48 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0300  cytochrome c, class IC  48.57 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949004  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1635  putative cytochrome  44.93 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.240566  normal  0.477632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  43.68 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0848  cytochrome C4 family protein  48.57 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1332  cytochrome c, class IC  48.57 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0014287  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1017  cytochrome c, class IC  48.57 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0966  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  48.57 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  45.31 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  42.86 
 
 		 191 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>